Protein–RNA interactions for Protein: Q1A5X7

WHAMMP3, Putative WASP homolog-associated protein with actin, membranes and microtubules-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WHAMMP3Q1A5X7 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
WHAMMP3Q1A5X7 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
WHAMMP3Q1A5X7 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
WHAMMP3Q1A5X7 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
WHAMMP3Q1A5X7 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
WHAMMP3Q1A5X7 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
WHAMMP3Q1A5X7 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
WHAMMP3Q1A5X7 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
WHAMMP3Q1A5X7 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
WHAMMP3Q1A5X7 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
WHAMMP3Q1A5X7 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
WHAMMP3Q1A5X7 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
WHAMMP3Q1A5X7 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
WHAMMP3Q1A5X7 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
WHAMMP3Q1A5X7 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
WHAMMP3Q1A5X7 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
WHAMMP3Q1A5X7 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
WHAMMP3Q1A5X7 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
WHAMMP3Q1A5X7 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
WHAMMP3Q1A5X7 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
WHAMMP3Q1A5X7 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
WHAMMP3Q1A5X7 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
WHAMMP3Q1A5X7 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
WHAMMP3Q1A5X7 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
WHAMMP3Q1A5X7 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
WHAMMP3Q1A5X7 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
WHAMMP3Q1A5X7 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
WHAMMP3Q1A5X7 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
WHAMMP3Q1A5X7 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
WHAMMP3Q1A5X7 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
WHAMMP3Q1A5X7 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
WHAMMP3Q1A5X7 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
WHAMMP3Q1A5X7 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
WHAMMP3Q1A5X7 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
WHAMMP3Q1A5X7 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
WHAMMP3Q1A5X7 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
WHAMMP3Q1A5X7 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
WHAMMP3Q1A5X7 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
WHAMMP3Q1A5X7 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
WHAMMP3Q1A5X7 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
WHAMMP3Q1A5X7 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
WHAMMP3Q1A5X7 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
WHAMMP3Q1A5X7 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
WHAMMP3Q1A5X7 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
WHAMMP3Q1A5X7 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
WHAMMP3Q1A5X7 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
WHAMMP3Q1A5X7 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
WHAMMP3Q1A5X7 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
WHAMMP3Q1A5X7 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
WHAMMP3Q1A5X7 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
WHAMMP3Q1A5X7 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
WHAMMP3Q1A5X7 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
WHAMMP3Q1A5X7 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
WHAMMP3Q1A5X7 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
WHAMMP3Q1A5X7 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
WHAMMP3Q1A5X7 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
WHAMMP3Q1A5X7 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
WHAMMP3Q1A5X7 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
WHAMMP3Q1A5X7 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
WHAMMP3Q1A5X7 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
WHAMMP3Q1A5X7 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
WHAMMP3Q1A5X7 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
WHAMMP3Q1A5X7 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
WHAMMP3Q1A5X7 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
WHAMMP3Q1A5X7 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
WHAMMP3Q1A5X7 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
WHAMMP3Q1A5X7 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
WHAMMP3Q1A5X7 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
WHAMMP3Q1A5X7 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
WHAMMP3Q1A5X7 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
WHAMMP3Q1A5X7 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
WHAMMP3Q1A5X7 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
WHAMMP3Q1A5X7 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
WHAMMP3Q1A5X7 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
WHAMMP3Q1A5X7 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
WHAMMP3Q1A5X7 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
WHAMMP3Q1A5X7 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
WHAMMP3Q1A5X7 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
WHAMMP3Q1A5X7 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
WHAMMP3Q1A5X7 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
WHAMMP3Q1A5X7 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
WHAMMP3Q1A5X7 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
WHAMMP3Q1A5X7 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
WHAMMP3Q1A5X7 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
WHAMMP3Q1A5X7 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
WHAMMP3Q1A5X7 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
WHAMMP3Q1A5X7 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
WHAMMP3Q1A5X7 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
WHAMMP3Q1A5X7 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
WHAMMP3Q1A5X7 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
WHAMMP3Q1A5X7 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
WHAMMP3Q1A5X7 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
WHAMMP3Q1A5X7 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
WHAMMP3Q1A5X7 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
WHAMMP3Q1A5X7 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
WHAMMP3Q1A5X7 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
WHAMMP3Q1A5X7 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
WHAMMP3Q1A5X7 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
WHAMMP3Q1A5X7 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
WHAMMP3Q1A5X7 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms