Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RTL8BQ17RB0 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RTL8BQ17RB0 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
RTL8BQ17RB0 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RTL8BQ17RB0 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RTL8BQ17RB0 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RTL8BQ17RB0 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RTL8BQ17RB0 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RTL8BQ17RB0 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RTL8BQ17RB0 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RTL8BQ17RB0 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RTL8BQ17RB0 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RTL8BQ17RB0 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RTL8BQ17RB0 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RTL8BQ17RB0 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RTL8BQ17RB0 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RTL8BQ17RB0 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RTL8BQ17RB0 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RTL8BQ17RB0 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RTL8BQ17RB0 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RTL8BQ17RB0 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RTL8BQ17RB0 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RTL8BQ17RB0 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RTL8BQ17RB0 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RTL8BQ17RB0 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RTL8BQ17RB0 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RTL8BQ17RB0 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RTL8BQ17RB0 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RTL8BQ17RB0 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RTL8BQ17RB0 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
RTL8BQ17RB0 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
RTL8BQ17RB0 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RTL8BQ17RB0 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RTL8BQ17RB0 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
RTL8BQ17RB0 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RTL8BQ17RB0 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RTL8BQ17RB0 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RTL8BQ17RB0 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RTL8BQ17RB0 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RTL8BQ17RB0 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RTL8BQ17RB0 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RTL8BQ17RB0 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RTL8BQ17RB0 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RTL8BQ17RB0 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RTL8BQ17RB0 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RTL8BQ17RB0 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RTL8BQ17RB0 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RTL8BQ17RB0 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RTL8BQ17RB0 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RTL8BQ17RB0 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RTL8BQ17RB0 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RTL8BQ17RB0 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RTL8BQ17RB0 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RTL8BQ17RB0 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RTL8BQ17RB0 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RTL8BQ17RB0 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RTL8BQ17RB0 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RTL8BQ17RB0 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RTL8BQ17RB0 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RTL8BQ17RB0 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RTL8BQ17RB0 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RTL8BQ17RB0 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RTL8BQ17RB0 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RTL8BQ17RB0 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RTL8BQ17RB0 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RTL8BQ17RB0 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RTL8BQ17RB0 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RTL8BQ17RB0 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RTL8BQ17RB0 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RTL8BQ17RB0 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RTL8BQ17RB0 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RTL8BQ17RB0 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RTL8BQ17RB0 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RTL8BQ17RB0 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RTL8BQ17RB0 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RTL8BQ17RB0 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RTL8BQ17RB0 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RTL8BQ17RB0 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RTL8BQ17RB0 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RTL8BQ17RB0 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RTL8BQ17RB0 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RTL8BQ17RB0 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RTL8BQ17RB0 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RTL8BQ17RB0 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RTL8BQ17RB0 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RTL8BQ17RB0 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RTL8BQ17RB0 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RTL8BQ17RB0 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RTL8BQ17RB0 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RTL8BQ17RB0 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RTL8BQ17RB0 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RTL8BQ17RB0 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RTL8BQ17RB0 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RTL8BQ17RB0 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RTL8BQ17RB0 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RTL8BQ17RB0 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RTL8BQ17RB0 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RTL8BQ17RB0 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RTL8BQ17RB0 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
RTL8BQ17RB0 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
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