Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PTPRNQ16849 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRNQ16849 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRNQ16849 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRNQ16849 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRNQ16849 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRNQ16849 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
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PTPRNQ16849 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPRNQ16849 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPRNQ16849 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
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PTPRNQ16849 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPRNQ16849 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPRNQ16849 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPRNQ16849 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
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PTPRNQ16849 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PTPRNQ16849 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPRNQ16849 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPRNQ16849 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPRNQ16849 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPRNQ16849 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPRNQ16849 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPRNQ16849 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPRNQ16849 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPRNQ16849 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPRNQ16849 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
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PTPRNQ16849 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
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PTPRNQ16849 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPRNQ16849 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
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PTPRNQ16849 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
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PTPRNQ16849 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPRNQ16849 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPRNQ16849 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPRNQ16849 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPRNQ16849 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPRNQ16849 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PTPRNQ16849 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PTPRNQ16849 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPRNQ16849 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPRNQ16849 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPRNQ16849 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPRNQ16849 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPRNQ16849 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPRNQ16849 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPRNQ16849 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
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