Protein–RNA interactions for Protein: Q16777

HIST2H2AC, Histone H2A type 2-C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 129 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST2H2ACQ16777 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HIST2H2ACQ16777 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HIST2H2ACQ16777 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HIST2H2ACQ16777 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HIST2H2ACQ16777 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HIST2H2ACQ16777 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HIST2H2ACQ16777 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
HIST2H2ACQ16777 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HIST2H2ACQ16777 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HIST2H2ACQ16777 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HIST2H2ACQ16777 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HIST2H2ACQ16777 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
HIST2H2ACQ16777 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HIST2H2ACQ16777 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HIST2H2ACQ16777 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HIST2H2ACQ16777 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HIST2H2ACQ16777 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HIST2H2ACQ16777 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HIST2H2ACQ16777 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
HIST2H2ACQ16777 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HIST2H2ACQ16777 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HIST2H2ACQ16777 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HIST2H2ACQ16777 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HIST2H2ACQ16777 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HIST2H2ACQ16777 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HIST2H2ACQ16777 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HIST2H2ACQ16777 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HIST2H2ACQ16777 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HIST2H2ACQ16777 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HIST2H2ACQ16777 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HIST2H2ACQ16777 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HIST2H2ACQ16777 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HIST2H2ACQ16777 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HIST2H2ACQ16777 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HIST2H2ACQ16777 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HIST2H2ACQ16777 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HIST2H2ACQ16777 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HIST2H2ACQ16777 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HIST2H2ACQ16777 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HIST2H2ACQ16777 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HIST2H2ACQ16777 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HIST2H2ACQ16777 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HIST2H2ACQ16777 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HIST2H2ACQ16777 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HIST2H2ACQ16777 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
HIST2H2ACQ16777 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HIST2H2ACQ16777 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HIST2H2ACQ16777 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HIST2H2ACQ16777 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HIST2H2ACQ16777 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HIST2H2ACQ16777 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HIST2H2ACQ16777 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HIST2H2ACQ16777 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HIST2H2ACQ16777 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HIST2H2ACQ16777 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HIST2H2ACQ16777 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HIST2H2ACQ16777 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HIST2H2ACQ16777 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
HIST2H2ACQ16777 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HIST2H2ACQ16777 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HIST2H2ACQ16777 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HIST2H2ACQ16777 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HIST2H2ACQ16777 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HIST2H2ACQ16777 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HIST2H2ACQ16777 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HIST2H2ACQ16777 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HIST2H2ACQ16777 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HIST2H2ACQ16777 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HIST2H2ACQ16777 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
HIST2H2ACQ16777 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HIST2H2ACQ16777 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
HIST2H2ACQ16777 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HIST2H2ACQ16777 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HIST2H2ACQ16777 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HIST2H2ACQ16777 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HIST2H2ACQ16777 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HIST2H2ACQ16777 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HIST2H2ACQ16777 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HIST2H2ACQ16777 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HIST2H2ACQ16777 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HIST2H2ACQ16777 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HIST2H2ACQ16777 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HIST2H2ACQ16777 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HIST2H2ACQ16777 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HIST2H2ACQ16777 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HIST2H2ACQ16777 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HIST2H2ACQ16777 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HIST2H2ACQ16777 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HIST2H2ACQ16777 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HIST2H2ACQ16777 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HIST2H2ACQ16777 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HIST2H2ACQ16777 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HIST2H2ACQ16777 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HIST2H2ACQ16777 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HIST2H2ACQ16777 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HIST2H2ACQ16777 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HIST2H2ACQ16777 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HIST2H2ACQ16777 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HIST2H2ACQ16777 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HIST2H2ACQ16777 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
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