Protein–RNA interactions for Protein: Q16720

ATP2B3, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B3Q16720 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
ATP2B3Q16720 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
ATP2B3Q16720 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
ATP2B3Q16720 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
ATP2B3Q16720 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ATP2B3Q16720 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ATP2B3Q16720 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ATP2B3Q16720 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ATP2B3Q16720 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ATP2B3Q16720 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ATP2B3Q16720 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ATP2B3Q16720 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ATP2B3Q16720 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ATP2B3Q16720 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ATP2B3Q16720 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ATP2B3Q16720 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ATP2B3Q16720 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ATP2B3Q16720 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ATP2B3Q16720 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ATP2B3Q16720 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ATP2B3Q16720 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ATP2B3Q16720 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ATP2B3Q16720 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ATP2B3Q16720 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ATP2B3Q16720 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ATP2B3Q16720 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ATP2B3Q16720 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ATP2B3Q16720 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ATP2B3Q16720 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ATP2B3Q16720 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ATP2B3Q16720 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ATP2B3Q16720 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ATP2B3Q16720 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ATP2B3Q16720 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ATP2B3Q16720 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ATP2B3Q16720 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ATP2B3Q16720 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
ATP2B3Q16720 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ATP2B3Q16720 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ATP2B3Q16720 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ATP2B3Q16720 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ATP2B3Q16720 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ATP2B3Q16720 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
ATP2B3Q16720 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ATP2B3Q16720 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ATP2B3Q16720 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ATP2B3Q16720 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ATP2B3Q16720 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ATP2B3Q16720 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ATP2B3Q16720 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ATP2B3Q16720 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ATP2B3Q16720 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ATP2B3Q16720 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ATP2B3Q16720 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ATP2B3Q16720 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ATP2B3Q16720 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
ATP2B3Q16720 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ATP2B3Q16720 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ATP2B3Q16720 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ATP2B3Q16720 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ATP2B3Q16720 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ATP2B3Q16720 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ATP2B3Q16720 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ATP2B3Q16720 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ATP2B3Q16720 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ATP2B3Q16720 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ATP2B3Q16720 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ATP2B3Q16720 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ATP2B3Q16720 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ATP2B3Q16720 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ATP2B3Q16720 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ATP2B3Q16720 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ATP2B3Q16720 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ATP2B3Q16720 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ATP2B3Q16720 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ATP2B3Q16720 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ATP2B3Q16720 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ATP2B3Q16720 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
ATP2B3Q16720 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
ATP2B3Q16720 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ATP2B3Q16720 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ATP2B3Q16720 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ATP2B3Q16720 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ATP2B3Q16720 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ATP2B3Q16720 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ATP2B3Q16720 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ATP2B3Q16720 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ATP2B3Q16720 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ATP2B3Q16720 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ATP2B3Q16720 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ATP2B3Q16720 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ATP2B3Q16720 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ATP2B3Q16720 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ATP2B3Q16720 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ATP2B3Q16720 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ATP2B3Q16720 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ATP2B3Q16720 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ATP2B3Q16720 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ATP2B3Q16720 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ATP2B3Q16720 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
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