Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTF1Q16619 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTF1Q16619 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTF1Q16619 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CTF1Q16619 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTF1Q16619 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTF1Q16619 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTF1Q16619 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTF1Q16619 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTF1Q16619 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTF1Q16619 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTF1Q16619 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTF1Q16619 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTF1Q16619 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTF1Q16619 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTF1Q16619 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTF1Q16619 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTF1Q16619 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTF1Q16619 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTF1Q16619 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTF1Q16619 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTF1Q16619 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTF1Q16619 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTF1Q16619 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTF1Q16619 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTF1Q16619 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTF1Q16619 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTF1Q16619 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTF1Q16619 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTF1Q16619 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTF1Q16619 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTF1Q16619 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTF1Q16619 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTF1Q16619 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTF1Q16619 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTF1Q16619 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTF1Q16619 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTF1Q16619 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTF1Q16619 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTF1Q16619 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CTF1Q16619 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTF1Q16619 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTF1Q16619 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTF1Q16619 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTF1Q16619 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTF1Q16619 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTF1Q16619 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTF1Q16619 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTF1Q16619 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTF1Q16619 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTF1Q16619 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTF1Q16619 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTF1Q16619 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTF1Q16619 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTF1Q16619 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTF1Q16619 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTF1Q16619 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTF1Q16619 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTF1Q16619 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTF1Q16619 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CTF1Q16619 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CTF1Q16619 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTF1Q16619 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTF1Q16619 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTF1Q16619 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTF1Q16619 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTF1Q16619 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTF1Q16619 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CTF1Q16619 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTF1Q16619 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTF1Q16619 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTF1Q16619 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTF1Q16619 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTF1Q16619 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTF1Q16619 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTF1Q16619 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTF1Q16619 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTF1Q16619 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTF1Q16619 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTF1Q16619 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CTF1Q16619 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTF1Q16619 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTF1Q16619 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTF1Q16619 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTF1Q16619 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTF1Q16619 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTF1Q16619 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CTF1Q16619 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTF1Q16619 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTF1Q16619 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTF1Q16619 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTF1Q16619 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTF1Q16619 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTF1Q16619 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTF1Q16619 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTF1Q16619 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTF1Q16619 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTF1Q16619 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTF1Q16619 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTF1Q16619 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
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