Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ECM1Q16610 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ECM1Q16610 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ECM1Q16610 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ECM1Q16610 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ECM1Q16610 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ECM1Q16610 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ECM1Q16610 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ECM1Q16610 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ECM1Q16610 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ECM1Q16610 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ECM1Q16610 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ECM1Q16610 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
ECM1Q16610 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
ECM1Q16610 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ECM1Q16610 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ECM1Q16610 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ECM1Q16610 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ECM1Q16610 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ECM1Q16610 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ECM1Q16610 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ECM1Q16610 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ECM1Q16610 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ECM1Q16610 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ECM1Q16610 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ECM1Q16610 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ECM1Q16610 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ECM1Q16610 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ECM1Q16610 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ECM1Q16610 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ECM1Q16610 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ECM1Q16610 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ECM1Q16610 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ECM1Q16610 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ECM1Q16610 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ECM1Q16610 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ECM1Q16610 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ECM1Q16610 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ECM1Q16610 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ECM1Q16610 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ECM1Q16610 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ECM1Q16610 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ECM1Q16610 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ECM1Q16610 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ECM1Q16610 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ECM1Q16610 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ECM1Q16610 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ECM1Q16610 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ECM1Q16610 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ECM1Q16610 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ECM1Q16610 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
ECM1Q16610 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ECM1Q16610 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ECM1Q16610 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ECM1Q16610 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ECM1Q16610 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ECM1Q16610 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ECM1Q16610 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ECM1Q16610 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ECM1Q16610 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ECM1Q16610 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ECM1Q16610 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ECM1Q16610 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ECM1Q16610 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ECM1Q16610 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ECM1Q16610 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ECM1Q16610 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ECM1Q16610 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ECM1Q16610 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ECM1Q16610 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ECM1Q16610 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ECM1Q16610 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ECM1Q16610 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
ECM1Q16610 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ECM1Q16610 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ECM1Q16610 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ECM1Q16610 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ECM1Q16610 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ECM1Q16610 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ECM1Q16610 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ECM1Q16610 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ECM1Q16610 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
ECM1Q16610 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ECM1Q16610 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ECM1Q16610 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ECM1Q16610 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ECM1Q16610 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ECM1Q16610 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ECM1Q16610 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ECM1Q16610 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ECM1Q16610 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ECM1Q16610 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ECM1Q16610 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ECM1Q16610 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ECM1Q16610 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ECM1Q16610 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ECM1Q16610 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ECM1Q16610 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ECM1Q16610 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ECM1Q16610 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
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