Protein–RNA interactions for Protein: Q16568

CARTPT, Cocaine- and amphetamine-regulated transcript protein, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARTPTQ16568 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CARTPTQ16568 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CARTPTQ16568 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CARTPTQ16568 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CARTPTQ16568 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CARTPTQ16568 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CARTPTQ16568 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CARTPTQ16568 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CARTPTQ16568 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CARTPTQ16568 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CARTPTQ16568 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CARTPTQ16568 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CARTPTQ16568 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CARTPTQ16568 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CARTPTQ16568 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CARTPTQ16568 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CARTPTQ16568 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CARTPTQ16568 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CARTPTQ16568 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CARTPTQ16568 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CARTPTQ16568 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CARTPTQ16568 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CARTPTQ16568 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CARTPTQ16568 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CARTPTQ16568 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CARTPTQ16568 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CARTPTQ16568 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CARTPTQ16568 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CARTPTQ16568 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CARTPTQ16568 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CARTPTQ16568 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CARTPTQ16568 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CARTPTQ16568 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CARTPTQ16568 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CARTPTQ16568 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CARTPTQ16568 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CARTPTQ16568 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CARTPTQ16568 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CARTPTQ16568 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CARTPTQ16568 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CARTPTQ16568 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CARTPTQ16568 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CARTPTQ16568 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CARTPTQ16568 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CARTPTQ16568 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CARTPTQ16568 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CARTPTQ16568 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CARTPTQ16568 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CARTPTQ16568 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CARTPTQ16568 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CARTPTQ16568 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CARTPTQ16568 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CARTPTQ16568 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CARTPTQ16568 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CARTPTQ16568 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CARTPTQ16568 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CARTPTQ16568 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CARTPTQ16568 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CARTPTQ16568 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CARTPTQ16568 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CARTPTQ16568 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CARTPTQ16568 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CARTPTQ16568 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CARTPTQ16568 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CARTPTQ16568 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CARTPTQ16568 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CARTPTQ16568 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CARTPTQ16568 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CARTPTQ16568 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CARTPTQ16568 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CARTPTQ16568 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CARTPTQ16568 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CARTPTQ16568 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CARTPTQ16568 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CARTPTQ16568 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CARTPTQ16568 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CARTPTQ16568 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CARTPTQ16568 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CARTPTQ16568 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CARTPTQ16568 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CARTPTQ16568 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CARTPTQ16568 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CARTPTQ16568 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CARTPTQ16568 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CARTPTQ16568 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CARTPTQ16568 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CARTPTQ16568 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CARTPTQ16568 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CARTPTQ16568 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CARTPTQ16568 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CARTPTQ16568 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CARTPTQ16568 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CARTPTQ16568 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CARTPTQ16568 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CARTPTQ16568 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CARTPTQ16568 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CARTPTQ16568 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CARTPTQ16568 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CARTPTQ16568 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CARTPTQ16568 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
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