Protein–RNA interactions for Protein: Q16563

SYPL1, Synaptophysin-like protein 1, humanhuman

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Length 259 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYPL1Q16563 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SYPL1Q16563 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SYPL1Q16563 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SYPL1Q16563 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SYPL1Q16563 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SYPL1Q16563 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SYPL1Q16563 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SYPL1Q16563 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SYPL1Q16563 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SYPL1Q16563 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SYPL1Q16563 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SYPL1Q16563 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SYPL1Q16563 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SYPL1Q16563 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SYPL1Q16563 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SYPL1Q16563 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SYPL1Q16563 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SYPL1Q16563 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SYPL1Q16563 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SYPL1Q16563 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SYPL1Q16563 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SYPL1Q16563 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SYPL1Q16563 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SYPL1Q16563 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SYPL1Q16563 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
SYPL1Q16563 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SYPL1Q16563 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SYPL1Q16563 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SYPL1Q16563 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SYPL1Q16563 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SYPL1Q16563 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SYPL1Q16563 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SYPL1Q16563 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SYPL1Q16563 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SYPL1Q16563 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SYPL1Q16563 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SYPL1Q16563 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SYPL1Q16563 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SYPL1Q16563 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SYPL1Q16563 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SYPL1Q16563 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SYPL1Q16563 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SYPL1Q16563 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SYPL1Q16563 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYPL1Q16563 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYPL1Q16563 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYPL1Q16563 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYPL1Q16563 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYPL1Q16563 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYPL1Q16563 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYPL1Q16563 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SYPL1Q16563 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYPL1Q16563 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYPL1Q16563 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYPL1Q16563 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYPL1Q16563 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYPL1Q16563 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYPL1Q16563 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYPL1Q16563 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYPL1Q16563 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYPL1Q16563 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYPL1Q16563 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SYPL1Q16563 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYPL1Q16563 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYPL1Q16563 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYPL1Q16563 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYPL1Q16563 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYPL1Q16563 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYPL1Q16563 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SYPL1Q16563 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SYPL1Q16563 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SYPL1Q16563 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SYPL1Q16563 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SYPL1Q16563 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SYPL1Q16563 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SYPL1Q16563 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SYPL1Q16563 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SYPL1Q16563 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SYPL1Q16563 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SYPL1Q16563 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SYPL1Q16563 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SYPL1Q16563 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SYPL1Q16563 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SYPL1Q16563 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SYPL1Q16563 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SYPL1Q16563 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SYPL1Q16563 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SYPL1Q16563 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SYPL1Q16563 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SYPL1Q16563 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SYPL1Q16563 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SYPL1Q16563 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SYPL1Q16563 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SYPL1Q16563 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SYPL1Q16563 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SYPL1Q16563 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SYPL1Q16563 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SYPL1Q16563 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SYPL1Q16563 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SYPL1Q16563 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
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