Protein–RNA interactions for Protein: Q15417

CNN3, Calponin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3Q15417 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CNN3Q15417 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CNN3Q15417 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CNN3Q15417 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CNN3Q15417 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CNN3Q15417 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CNN3Q15417 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CNN3Q15417 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
CNN3Q15417 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CNN3Q15417 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
CNN3Q15417 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
CNN3Q15417 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CNN3Q15417 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CNN3Q15417 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CNN3Q15417 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CNN3Q15417 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CNN3Q15417 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CNN3Q15417 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CNN3Q15417 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CNN3Q15417 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CNN3Q15417 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CNN3Q15417 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CNN3Q15417 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CNN3Q15417 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CNN3Q15417 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CNN3Q15417 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CNN3Q15417 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CNN3Q15417 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CNN3Q15417 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CNN3Q15417 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CNN3Q15417 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CNN3Q15417 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CNN3Q15417 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CNN3Q15417 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CNN3Q15417 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CNN3Q15417 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CNN3Q15417 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CNN3Q15417 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CNN3Q15417 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CNN3Q15417 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
CNN3Q15417 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
CNN3Q15417 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
CNN3Q15417 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CNN3Q15417 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CNN3Q15417 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CNN3Q15417 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CNN3Q15417 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CNN3Q15417 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CNN3Q15417 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CNN3Q15417 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CNN3Q15417 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CNN3Q15417 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CNN3Q15417 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CNN3Q15417 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CNN3Q15417 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CNN3Q15417 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CNN3Q15417 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CNN3Q15417 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CNN3Q15417 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
CNN3Q15417 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CNN3Q15417 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CNN3Q15417 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CNN3Q15417 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CNN3Q15417 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CNN3Q15417 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CNN3Q15417 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CNN3Q15417 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CNN3Q15417 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CNN3Q15417 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CNN3Q15417 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CNN3Q15417 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CNN3Q15417 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
CNN3Q15417 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CNN3Q15417 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CNN3Q15417 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CNN3Q15417 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CNN3Q15417 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CNN3Q15417 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CNN3Q15417 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CNN3Q15417 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CNN3Q15417 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CNN3Q15417 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CNN3Q15417 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CNN3Q15417 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
CNN3Q15417 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CNN3Q15417 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CNN3Q15417 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CNN3Q15417 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CNN3Q15417 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CNN3Q15417 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CNN3Q15417 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CNN3Q15417 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CNN3Q15417 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CNN3Q15417 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CNN3Q15417 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CNN3Q15417 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CNN3Q15417 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
CNN3Q15417 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CNN3Q15417 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CNN3Q15417 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
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