Protein–RNA interactions for Protein: Q15406

NR6A1, Nuclear receptor subfamily 6 group A member 1, humanhuman

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Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR6A1Q15406 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NR6A1Q15406 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NR6A1Q15406 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NR6A1Q15406 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NR6A1Q15406 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
NR6A1Q15406 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NR6A1Q15406 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NR6A1Q15406 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NR6A1Q15406 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NR6A1Q15406 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NR6A1Q15406 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NR6A1Q15406 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
NR6A1Q15406 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NR6A1Q15406 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
NR6A1Q15406 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NR6A1Q15406 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NR6A1Q15406 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NR6A1Q15406 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NR6A1Q15406 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NR6A1Q15406 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NR6A1Q15406 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NR6A1Q15406 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NR6A1Q15406 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NR6A1Q15406 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NR6A1Q15406 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NR6A1Q15406 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NR6A1Q15406 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NR6A1Q15406 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NR6A1Q15406 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NR6A1Q15406 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NR6A1Q15406 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NR6A1Q15406 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NR6A1Q15406 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NR6A1Q15406 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NR6A1Q15406 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NR6A1Q15406 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NR6A1Q15406 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NR6A1Q15406 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NR6A1Q15406 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NR6A1Q15406 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NR6A1Q15406 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NR6A1Q15406 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NR6A1Q15406 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NR6A1Q15406 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NR6A1Q15406 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NR6A1Q15406 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NR6A1Q15406 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NR6A1Q15406 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NR6A1Q15406 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NR6A1Q15406 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NR6A1Q15406 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NR6A1Q15406 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NR6A1Q15406 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NR6A1Q15406 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NR6A1Q15406 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NR6A1Q15406 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NR6A1Q15406 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NR6A1Q15406 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NR6A1Q15406 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NR6A1Q15406 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NR6A1Q15406 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NR6A1Q15406 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NR6A1Q15406 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NR6A1Q15406 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NR6A1Q15406 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NR6A1Q15406 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NR6A1Q15406 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NR6A1Q15406 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
NR6A1Q15406 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
NR6A1Q15406 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
NR6A1Q15406 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NR6A1Q15406 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NR6A1Q15406 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NR6A1Q15406 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NR6A1Q15406 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NR6A1Q15406 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NR6A1Q15406 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NR6A1Q15406 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NR6A1Q15406 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
NR6A1Q15406 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NR6A1Q15406 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NR6A1Q15406 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NR6A1Q15406 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
NR6A1Q15406 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NR6A1Q15406 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NR6A1Q15406 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NR6A1Q15406 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NR6A1Q15406 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NR6A1Q15406 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NR6A1Q15406 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NR6A1Q15406 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NR6A1Q15406 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NR6A1Q15406 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NR6A1Q15406 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NR6A1Q15406 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NR6A1Q15406 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NR6A1Q15406 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NR6A1Q15406 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NR6A1Q15406 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NR6A1Q15406 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
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