Protein–RNA interactions for Protein: Q15361

TTF1, Transcription termination factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 905 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF1Q15361 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TTF1Q15361 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TTF1Q15361 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TTF1Q15361 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TTF1Q15361 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TTF1Q15361 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TTF1Q15361 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TTF1Q15361 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TTF1Q15361 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TTF1Q15361 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TTF1Q15361 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TTF1Q15361 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TTF1Q15361 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TTF1Q15361 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TTF1Q15361 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TTF1Q15361 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
TTF1Q15361 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TTF1Q15361 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TTF1Q15361 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
TTF1Q15361 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
TTF1Q15361 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
TTF1Q15361 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TTF1Q15361 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TTF1Q15361 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TTF1Q15361 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TTF1Q15361 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TTF1Q15361 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TTF1Q15361 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TTF1Q15361 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TTF1Q15361 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
TTF1Q15361 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TTF1Q15361 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TTF1Q15361 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TTF1Q15361 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TTF1Q15361 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TTF1Q15361 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
TTF1Q15361 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TTF1Q15361 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TTF1Q15361 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TTF1Q15361 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TTF1Q15361 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TTF1Q15361 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TTF1Q15361 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TTF1Q15361 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TTF1Q15361 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TTF1Q15361 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TTF1Q15361 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
TTF1Q15361 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TTF1Q15361 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TTF1Q15361 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TTF1Q15361 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TTF1Q15361 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TTF1Q15361 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TTF1Q15361 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TTF1Q15361 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
TTF1Q15361 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
TTF1Q15361 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TTF1Q15361 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TTF1Q15361 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TTF1Q15361 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TTF1Q15361 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TTF1Q15361 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TTF1Q15361 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TTF1Q15361 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TTF1Q15361 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TTF1Q15361 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TTF1Q15361 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TTF1Q15361 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TTF1Q15361 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TTF1Q15361 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TTF1Q15361 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TTF1Q15361 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
TTF1Q15361 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
TTF1Q15361 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
TTF1Q15361 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TTF1Q15361 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TTF1Q15361 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TTF1Q15361 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TTF1Q15361 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TTF1Q15361 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TTF1Q15361 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TTF1Q15361 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TTF1Q15361 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TTF1Q15361 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TTF1Q15361 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TTF1Q15361 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TTF1Q15361 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TTF1Q15361 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TTF1Q15361 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TTF1Q15361 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TTF1Q15361 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TTF1Q15361 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TTF1Q15361 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TTF1Q15361 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TTF1Q15361 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
TTF1Q15361 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TTF1Q15361 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TTF1Q15361 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TTF1Q15361 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TTF1Q15361 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
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