Protein–RNA interactions for Protein: Q15042

RAB3GAP1, Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit, humanhuman

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Length 981 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3GAP1Q15042 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RAB3GAP1Q15042 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RAB3GAP1Q15042 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.04
RAB3GAP1Q15042 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RAB3GAP1Q15042 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RAB3GAP1Q15042 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RAB3GAP1Q15042 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RAB3GAP1Q15042 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RAB3GAP1Q15042 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RAB3GAP1Q15042 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RAB3GAP1Q15042 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RAB3GAP1Q15042 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RAB3GAP1Q15042 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RAB3GAP1Q15042 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
RAB3GAP1Q15042 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RAB3GAP1Q15042 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RAB3GAP1Q15042 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RAB3GAP1Q15042 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RAB3GAP1Q15042 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
RAB3GAP1Q15042 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RAB3GAP1Q15042 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RAB3GAP1Q15042 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RAB3GAP1Q15042 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RAB3GAP1Q15042 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RAB3GAP1Q15042 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RAB3GAP1Q15042 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RAB3GAP1Q15042 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RAB3GAP1Q15042 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RAB3GAP1Q15042 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
RAB3GAP1Q15042 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RAB3GAP1Q15042 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RAB3GAP1Q15042 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RAB3GAP1Q15042 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
RAB3GAP1Q15042 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RAB3GAP1Q15042 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RAB3GAP1Q15042 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
RAB3GAP1Q15042 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RAB3GAP1Q15042 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RAB3GAP1Q15042 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RAB3GAP1Q15042 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RAB3GAP1Q15042 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RAB3GAP1Q15042 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RAB3GAP1Q15042 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
RAB3GAP1Q15042 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RAB3GAP1Q15042 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RAB3GAP1Q15042 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RAB3GAP1Q15042 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RAB3GAP1Q15042 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
RAB3GAP1Q15042 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
RAB3GAP1Q15042 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
RAB3GAP1Q15042 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
RAB3GAP1Q15042 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RAB3GAP1Q15042 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RAB3GAP1Q15042 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RAB3GAP1Q15042 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RAB3GAP1Q15042 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RAB3GAP1Q15042 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RAB3GAP1Q15042 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RAB3GAP1Q15042 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RAB3GAP1Q15042 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RAB3GAP1Q15042 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RAB3GAP1Q15042 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RAB3GAP1Q15042 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RAB3GAP1Q15042 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RAB3GAP1Q15042 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RAB3GAP1Q15042 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RAB3GAP1Q15042 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RAB3GAP1Q15042 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RAB3GAP1Q15042 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RAB3GAP1Q15042 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
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RAB3GAP1Q15042 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RAB3GAP1Q15042 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RAB3GAP1Q15042 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RAB3GAP1Q15042 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RAB3GAP1Q15042 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RAB3GAP1Q15042 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RAB3GAP1Q15042 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RAB3GAP1Q15042 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RAB3GAP1Q15042 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RAB3GAP1Q15042 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
RAB3GAP1Q15042 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
RAB3GAP1Q15042 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
RAB3GAP1Q15042 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
RAB3GAP1Q15042 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
RAB3GAP1Q15042 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
RAB3GAP1Q15042 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
RAB3GAP1Q15042 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RAB3GAP1Q15042 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RAB3GAP1Q15042 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
RAB3GAP1Q15042 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RAB3GAP1Q15042 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RAB3GAP1Q15042 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RAB3GAP1Q15042 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RAB3GAP1Q15042 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RAB3GAP1Q15042 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RAB3GAP1Q15042 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RAB3GAP1Q15042 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RAB3GAP1Q15042 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
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