Protein–RNA interactions for Protein: Q14994

NR1I3, Nuclear receptor subfamily 1 group I member 3, humanhuman

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Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1I3Q14994 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NR1I3Q14994 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NR1I3Q14994 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NR1I3Q14994 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
NR1I3Q14994 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NR1I3Q14994 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NR1I3Q14994 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NR1I3Q14994 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NR1I3Q14994 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NR1I3Q14994 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NR1I3Q14994 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NR1I3Q14994 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
NR1I3Q14994 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NR1I3Q14994 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NR1I3Q14994 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NR1I3Q14994 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NR1I3Q14994 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NR1I3Q14994 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NR1I3Q14994 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NR1I3Q14994 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NR1I3Q14994 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NR1I3Q14994 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NR1I3Q14994 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NR1I3Q14994 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NR1I3Q14994 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NR1I3Q14994 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NR1I3Q14994 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NR1I3Q14994 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NR1I3Q14994 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NR1I3Q14994 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NR1I3Q14994 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NR1I3Q14994 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NR1I3Q14994 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NR1I3Q14994 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NR1I3Q14994 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NR1I3Q14994 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NR1I3Q14994 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NR1I3Q14994 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NR1I3Q14994 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NR1I3Q14994 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NR1I3Q14994 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NR1I3Q14994 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NR1I3Q14994 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NR1I3Q14994 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NR1I3Q14994 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NR1I3Q14994 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NR1I3Q14994 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NR1I3Q14994 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NR1I3Q14994 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NR1I3Q14994 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NR1I3Q14994 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NR1I3Q14994 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NR1I3Q14994 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
NR1I3Q14994 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NR1I3Q14994 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NR1I3Q14994 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NR1I3Q14994 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.6
NR1I3Q14994 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NR1I3Q14994 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NR1I3Q14994 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NR1I3Q14994 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NR1I3Q14994 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NR1I3Q14994 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NR1I3Q14994 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
NR1I3Q14994 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
NR1I3Q14994 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NR1I3Q14994 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
NR1I3Q14994 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NR1I3Q14994 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
NR1I3Q14994 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NR1I3Q14994 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NR1I3Q14994 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NR1I3Q14994 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NR1I3Q14994 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NR1I3Q14994 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
NR1I3Q14994 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NR1I3Q14994 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NR1I3Q14994 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NR1I3Q14994 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NR1I3Q14994 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NR1I3Q14994 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NR1I3Q14994 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NR1I3Q14994 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NR1I3Q14994 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NR1I3Q14994 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NR1I3Q14994 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NR1I3Q14994 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NR1I3Q14994 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
NR1I3Q14994 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NR1I3Q14994 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NR1I3Q14994 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NR1I3Q14994 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NR1I3Q14994 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NR1I3Q14994 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NR1I3Q14994 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NR1I3Q14994 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NR1I3Q14994 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NR1I3Q14994 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NR1I3Q14994 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NR1I3Q14994 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
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