Protein–RNA interactions for Protein: Q14990

ODF1, Outer dense fiber protein 1, humanhuman

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF1Q14990 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ODF1Q14990 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ODF1Q14990 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ODF1Q14990 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ODF1Q14990 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ODF1Q14990 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ODF1Q14990 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ODF1Q14990 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ODF1Q14990 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ODF1Q14990 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ODF1Q14990 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ODF1Q14990 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ODF1Q14990 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ODF1Q14990 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ODF1Q14990 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ODF1Q14990 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ODF1Q14990 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ODF1Q14990 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ODF1Q14990 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ODF1Q14990 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ODF1Q14990 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ODF1Q14990 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ODF1Q14990 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ODF1Q14990 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ODF1Q14990 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ODF1Q14990 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ODF1Q14990 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ODF1Q14990 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ODF1Q14990 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ODF1Q14990 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ODF1Q14990 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ODF1Q14990 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ODF1Q14990 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ODF1Q14990 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ODF1Q14990 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ODF1Q14990 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ODF1Q14990 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ODF1Q14990 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ODF1Q14990 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ODF1Q14990 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ODF1Q14990 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ODF1Q14990 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ODF1Q14990 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ODF1Q14990 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ODF1Q14990 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ODF1Q14990 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ODF1Q14990 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ODF1Q14990 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ODF1Q14990 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ODF1Q14990 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ODF1Q14990 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ODF1Q14990 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ODF1Q14990 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ODF1Q14990 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ODF1Q14990 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ODF1Q14990 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ODF1Q14990 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ODF1Q14990 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ODF1Q14990 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ODF1Q14990 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ODF1Q14990 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ODF1Q14990 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ODF1Q14990 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ODF1Q14990 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ODF1Q14990 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ODF1Q14990 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ODF1Q14990 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ODF1Q14990 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ODF1Q14990 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ODF1Q14990 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ODF1Q14990 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ODF1Q14990 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ODF1Q14990 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ODF1Q14990 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ODF1Q14990 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ODF1Q14990 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ODF1Q14990 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ODF1Q14990 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ODF1Q14990 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ODF1Q14990 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ODF1Q14990 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ODF1Q14990 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ODF1Q14990 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ODF1Q14990 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ODF1Q14990 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ODF1Q14990 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ODF1Q14990 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ODF1Q14990 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ODF1Q14990 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ODF1Q14990 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ODF1Q14990 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ODF1Q14990 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ODF1Q14990 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ODF1Q14990 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ODF1Q14990 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ODF1Q14990 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ODF1Q14990 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ODF1Q14990 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ODF1Q14990 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ODF1Q14990 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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