Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CHD4Q14839 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CHD4Q14839 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CHD4Q14839 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CHD4Q14839 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
CHD4Q14839 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CHD4Q14839 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
CHD4Q14839 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CHD4Q14839 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CHD4Q14839 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CHD4Q14839 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CHD4Q14839 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CHD4Q14839 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CHD4Q14839 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CHD4Q14839 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CHD4Q14839 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
CHD4Q14839 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
CHD4Q14839 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CHD4Q14839 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CHD4Q14839 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CHD4Q14839 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CHD4Q14839 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
CHD4Q14839 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
CHD4Q14839 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
CHD4Q14839 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CHD4Q14839 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CHD4Q14839 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
CHD4Q14839 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CHD4Q14839 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CHD4Q14839 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CHD4Q14839 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CHD4Q14839 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CHD4Q14839 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CHD4Q14839 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CHD4Q14839 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CHD4Q14839 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CHD4Q14839 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
CHD4Q14839 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CHD4Q14839 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CHD4Q14839 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CHD4Q14839 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CHD4Q14839 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CHD4Q14839 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CHD4Q14839 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CHD4Q14839 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CHD4Q14839 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CHD4Q14839 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CHD4Q14839 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CHD4Q14839 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CHD4Q14839 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CHD4Q14839 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CHD4Q14839 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CHD4Q14839 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CHD4Q14839 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CHD4Q14839 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CHD4Q14839 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CHD4Q14839 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CHD4Q14839 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CHD4Q14839 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CHD4Q14839 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CHD4Q14839 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CHD4Q14839 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CHD4Q14839 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CHD4Q14839 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CHD4Q14839 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CHD4Q14839 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
CHD4Q14839 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CHD4Q14839 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CHD4Q14839 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
CHD4Q14839 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CHD4Q14839 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CHD4Q14839 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CHD4Q14839 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CHD4Q14839 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CHD4Q14839 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CHD4Q14839 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CHD4Q14839 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CHD4Q14839 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CHD4Q14839 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CHD4Q14839 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CHD4Q14839 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CHD4Q14839 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CHD4Q14839 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CHD4Q14839 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CHD4Q14839 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CHD4Q14839 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CHD4Q14839 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CHD4Q14839 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CHD4Q14839 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CHD4Q14839 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CHD4Q14839 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CHD4Q14839 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CHD4Q14839 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CHD4Q14839 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CHD4Q14839 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CHD4Q14839 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CHD4Q14839 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CHD4Q14839 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
CHD4Q14839 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CHD4Q14839 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
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