Protein–RNA interactions for Protein: Q14264

ERV3-1, Endogenous retrovirus group 3 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERV3-1Q14264 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ERV3-1Q14264 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
ERV3-1Q14264 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ERV3-1Q14264 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ERV3-1Q14264 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ERV3-1Q14264 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ERV3-1Q14264 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ERV3-1Q14264 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ERV3-1Q14264 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ERV3-1Q14264 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
ERV3-1Q14264 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ERV3-1Q14264 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ERV3-1Q14264 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ERV3-1Q14264 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ERV3-1Q14264 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ERV3-1Q14264 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ERV3-1Q14264 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ERV3-1Q14264 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ERV3-1Q14264 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ERV3-1Q14264 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ERV3-1Q14264 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ERV3-1Q14264 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ERV3-1Q14264 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ERV3-1Q14264 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ERV3-1Q14264 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ERV3-1Q14264 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ERV3-1Q14264 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ERV3-1Q14264 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ERV3-1Q14264 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ERV3-1Q14264 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
ERV3-1Q14264 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ERV3-1Q14264 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
ERV3-1Q14264 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
ERV3-1Q14264 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ERV3-1Q14264 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ERV3-1Q14264 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ERV3-1Q14264 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ERV3-1Q14264 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ERV3-1Q14264 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ERV3-1Q14264 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ERV3-1Q14264 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ERV3-1Q14264 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ERV3-1Q14264 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ERV3-1Q14264 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ERV3-1Q14264 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ERV3-1Q14264 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ERV3-1Q14264 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ERV3-1Q14264 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ERV3-1Q14264 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ERV3-1Q14264 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ERV3-1Q14264 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ERV3-1Q14264 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ERV3-1Q14264 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ERV3-1Q14264 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ERV3-1Q14264 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ERV3-1Q14264 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ERV3-1Q14264 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
ERV3-1Q14264 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ERV3-1Q14264 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ERV3-1Q14264 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ERV3-1Q14264 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
ERV3-1Q14264 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ERV3-1Q14264 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ERV3-1Q14264 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ERV3-1Q14264 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ERV3-1Q14264 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ERV3-1Q14264 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ERV3-1Q14264 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ERV3-1Q14264 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ERV3-1Q14264 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ERV3-1Q14264 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ERV3-1Q14264 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ERV3-1Q14264 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ERV3-1Q14264 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ERV3-1Q14264 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ERV3-1Q14264 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ERV3-1Q14264 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ERV3-1Q14264 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ERV3-1Q14264 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ERV3-1Q14264 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ERV3-1Q14264 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ERV3-1Q14264 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ERV3-1Q14264 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ERV3-1Q14264 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
ERV3-1Q14264 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ERV3-1Q14264 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
ERV3-1Q14264 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ERV3-1Q14264 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ERV3-1Q14264 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ERV3-1Q14264 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ERV3-1Q14264 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ERV3-1Q14264 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ERV3-1Q14264 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
ERV3-1Q14264 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ERV3-1Q14264 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ERV3-1Q14264 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ERV3-1Q14264 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ERV3-1Q14264 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ERV3-1Q14264 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ERV3-1Q14264 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms