Protein–RNA interactions for Protein: Q14123

PDE1C, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE1CQ14123 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDE1CQ14123 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDE1CQ14123 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDE1CQ14123 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDE1CQ14123 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDE1CQ14123 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDE1CQ14123 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDE1CQ14123 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PDE1CQ14123 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PDE1CQ14123 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDE1CQ14123 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDE1CQ14123 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDE1CQ14123 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDE1CQ14123 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDE1CQ14123 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDE1CQ14123 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDE1CQ14123 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PDE1CQ14123 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDE1CQ14123 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PDE1CQ14123 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDE1CQ14123 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDE1CQ14123 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDE1CQ14123 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDE1CQ14123 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDE1CQ14123 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDE1CQ14123 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PDE1CQ14123 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDE1CQ14123 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDE1CQ14123 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDE1CQ14123 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDE1CQ14123 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDE1CQ14123 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDE1CQ14123 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDE1CQ14123 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PDE1CQ14123 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDE1CQ14123 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PDE1CQ14123 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDE1CQ14123 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDE1CQ14123 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDE1CQ14123 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDE1CQ14123 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDE1CQ14123 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDE1CQ14123 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDE1CQ14123 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDE1CQ14123 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDE1CQ14123 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PDE1CQ14123 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PDE1CQ14123 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDE1CQ14123 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDE1CQ14123 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDE1CQ14123 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDE1CQ14123 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDE1CQ14123 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDE1CQ14123 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDE1CQ14123 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDE1CQ14123 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDE1CQ14123 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDE1CQ14123 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDE1CQ14123 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDE1CQ14123 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDE1CQ14123 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDE1CQ14123 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDE1CQ14123 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDE1CQ14123 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDE1CQ14123 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PDE1CQ14123 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDE1CQ14123 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDE1CQ14123 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDE1CQ14123 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PDE1CQ14123 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PDE1CQ14123 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDE1CQ14123 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PDE1CQ14123 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDE1CQ14123 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDE1CQ14123 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDE1CQ14123 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDE1CQ14123 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDE1CQ14123 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDE1CQ14123 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDE1CQ14123 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDE1CQ14123 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDE1CQ14123 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDE1CQ14123 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDE1CQ14123 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDE1CQ14123 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDE1CQ14123 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDE1CQ14123 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDE1CQ14123 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDE1CQ14123 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDE1CQ14123 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDE1CQ14123 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDE1CQ14123 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDE1CQ14123 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDE1CQ14123 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDE1CQ14123 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDE1CQ14123 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PDE1CQ14123 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDE1CQ14123 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDE1CQ14123 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDE1CQ14123 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
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