Protein–RNA interactions for Protein: Q13956

PDE6H, Retinal cone rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

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Length 83 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6HQ13956 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PDE6HQ13956 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
PDE6HQ13956 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
PDE6HQ13956 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
PDE6HQ13956 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
PDE6HQ13956 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDE6HQ13956 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDE6HQ13956 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDE6HQ13956 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDE6HQ13956 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDE6HQ13956 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDE6HQ13956 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDE6HQ13956 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDE6HQ13956 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDE6HQ13956 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDE6HQ13956 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDE6HQ13956 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDE6HQ13956 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDE6HQ13956 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDE6HQ13956 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDE6HQ13956 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDE6HQ13956 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDE6HQ13956 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDE6HQ13956 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDE6HQ13956 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDE6HQ13956 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDE6HQ13956 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDE6HQ13956 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDE6HQ13956 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDE6HQ13956 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDE6HQ13956 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDE6HQ13956 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDE6HQ13956 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDE6HQ13956 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDE6HQ13956 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDE6HQ13956 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDE6HQ13956 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDE6HQ13956 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDE6HQ13956 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDE6HQ13956 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDE6HQ13956 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDE6HQ13956 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDE6HQ13956 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDE6HQ13956 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDE6HQ13956 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDE6HQ13956 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PDE6HQ13956 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDE6HQ13956 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDE6HQ13956 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDE6HQ13956 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDE6HQ13956 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDE6HQ13956 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDE6HQ13956 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDE6HQ13956 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDE6HQ13956 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDE6HQ13956 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDE6HQ13956 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
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PDE6HQ13956 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
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PDE6HQ13956 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDE6HQ13956 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
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PDE6HQ13956 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PDE6HQ13956 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PDE6HQ13956 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PDE6HQ13956 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
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PDE6HQ13956 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
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PDE6HQ13956 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PDE6HQ13956 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PDE6HQ13956 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PDE6HQ13956 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PDE6HQ13956 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PDE6HQ13956 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PDE6HQ13956 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PDE6HQ13956 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PDE6HQ13956 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PDE6HQ13956 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PDE6HQ13956 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PDE6HQ13956 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PDE6HQ13956 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PDE6HQ13956 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PDE6HQ13956 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PDE6HQ13956 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PDE6HQ13956 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PDE6HQ13956 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PDE6HQ13956 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PDE6HQ13956 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PDE6HQ13956 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PDE6HQ13956 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PDE6HQ13956 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PDE6HQ13956 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PDE6HQ13956 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
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