Protein–RNA interactions for Protein: Q13905

RAPGEF1, Rap guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

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Length 1,077 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPGEF1Q13905 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RAPGEF1Q13905 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RAPGEF1Q13905 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RAPGEF1Q13905 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RAPGEF1Q13905 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RAPGEF1Q13905 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RAPGEF1Q13905 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RAPGEF1Q13905 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RAPGEF1Q13905 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RAPGEF1Q13905 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RAPGEF1Q13905 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RAPGEF1Q13905 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RAPGEF1Q13905 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RAPGEF1Q13905 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RAPGEF1Q13905 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RAPGEF1Q13905 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
RAPGEF1Q13905 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RAPGEF1Q13905 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RAPGEF1Q13905 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RAPGEF1Q13905 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RAPGEF1Q13905 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RAPGEF1Q13905 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RAPGEF1Q13905 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RAPGEF1Q13905 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RAPGEF1Q13905 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
RAPGEF1Q13905 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RAPGEF1Q13905 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RAPGEF1Q13905 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RAPGEF1Q13905 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RAPGEF1Q13905 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RAPGEF1Q13905 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RAPGEF1Q13905 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RAPGEF1Q13905 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RAPGEF1Q13905 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RAPGEF1Q13905 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RAPGEF1Q13905 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RAPGEF1Q13905 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RAPGEF1Q13905 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RAPGEF1Q13905 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RAPGEF1Q13905 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RAPGEF1Q13905 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RAPGEF1Q13905 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
RAPGEF1Q13905 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RAPGEF1Q13905 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RAPGEF1Q13905 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
RAPGEF1Q13905 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RAPGEF1Q13905 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RAPGEF1Q13905 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RAPGEF1Q13905 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RAPGEF1Q13905 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RAPGEF1Q13905 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RAPGEF1Q13905 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RAPGEF1Q13905 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RAPGEF1Q13905 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RAPGEF1Q13905 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RAPGEF1Q13905 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RAPGEF1Q13905 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RAPGEF1Q13905 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RAPGEF1Q13905 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RAPGEF1Q13905 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
RAPGEF1Q13905 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RAPGEF1Q13905 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RAPGEF1Q13905 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RAPGEF1Q13905 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RAPGEF1Q13905 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RAPGEF1Q13905 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RAPGEF1Q13905 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RAPGEF1Q13905 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RAPGEF1Q13905 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RAPGEF1Q13905 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RAPGEF1Q13905 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RAPGEF1Q13905 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
RAPGEF1Q13905 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RAPGEF1Q13905 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RAPGEF1Q13905 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
RAPGEF1Q13905 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RAPGEF1Q13905 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RAPGEF1Q13905 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RAPGEF1Q13905 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RAPGEF1Q13905 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RAPGEF1Q13905 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
RAPGEF1Q13905 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RAPGEF1Q13905 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RAPGEF1Q13905 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
RAPGEF1Q13905 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
RAPGEF1Q13905 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RAPGEF1Q13905 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RAPGEF1Q13905 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RAPGEF1Q13905 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RAPGEF1Q13905 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RAPGEF1Q13905 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RAPGEF1Q13905 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RAPGEF1Q13905 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RAPGEF1Q13905 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RAPGEF1Q13905 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RAPGEF1Q13905 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RAPGEF1Q13905 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RAPGEF1Q13905 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RAPGEF1Q13905 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RAPGEF1Q13905 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
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