Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.27■■□□□ 1
APOFQ13790 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
APOFQ13790 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
APOFQ13790 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
APOFQ13790 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
APOFQ13790 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
APOFQ13790 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
APOFQ13790 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
APOFQ13790 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
APOFQ13790 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
APOFQ13790 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
APOFQ13790 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
APOFQ13790 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
APOFQ13790 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
APOFQ13790 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
APOFQ13790 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
APOFQ13790 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
APOFQ13790 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
APOFQ13790 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
APOFQ13790 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
APOFQ13790 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
APOFQ13790 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
APOFQ13790 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
APOFQ13790 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
APOFQ13790 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
APOFQ13790 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
APOFQ13790 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
APOFQ13790 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
APOFQ13790 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
APOFQ13790 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
APOFQ13790 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
APOFQ13790 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
APOFQ13790 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
APOFQ13790 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
APOFQ13790 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
APOFQ13790 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
APOFQ13790 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
APOFQ13790 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
APOFQ13790 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
APOFQ13790 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
APOFQ13790 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
APOFQ13790 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
APOFQ13790 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
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APOFQ13790 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
APOFQ13790 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
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APOFQ13790 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
APOFQ13790 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
APOFQ13790 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
APOFQ13790 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
APOFQ13790 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
APOFQ13790 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
APOFQ13790 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
APOFQ13790 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
APOFQ13790 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
APOFQ13790 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
APOFQ13790 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
APOFQ13790 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
APOFQ13790 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
APOFQ13790 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
APOFQ13790 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
APOFQ13790 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
APOFQ13790 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
APOFQ13790 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
APOFQ13790 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
APOFQ13790 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
APOFQ13790 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
APOFQ13790 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
APOFQ13790 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
APOFQ13790 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
APOFQ13790 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
APOFQ13790 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
APOFQ13790 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
APOFQ13790 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
APOFQ13790 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
APOFQ13790 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
APOFQ13790 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
APOFQ13790 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
APOFQ13790 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
APOFQ13790 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
APOFQ13790 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
APOFQ13790 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
APOFQ13790 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
APOFQ13790 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
APOFQ13790 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
APOFQ13790 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
APOFQ13790 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
APOFQ13790 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
APOFQ13790 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
APOFQ13790 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
APOFQ13790 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
APOFQ13790 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
APOFQ13790 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
APOFQ13790 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
APOFQ13790 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
APOFQ13790 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
APOFQ13790 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
APOFQ13790 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
APOFQ13790 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
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