Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
NEUROD1Q13562 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
NEUROD1Q13562 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
NEUROD1Q13562 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
NEUROD1Q13562 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
NEUROD1Q13562 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
NEUROD1Q13562 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
NEUROD1Q13562 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
NEUROD1Q13562 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
NEUROD1Q13562 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
NEUROD1Q13562 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
NEUROD1Q13562 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
NEUROD1Q13562 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
NEUROD1Q13562 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
NEUROD1Q13562 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
NEUROD1Q13562 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
NEUROD1Q13562 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
NEUROD1Q13562 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
NEUROD1Q13562 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC33.65■■■□□ 2.98
NEUROD1Q13562 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
NEUROD1Q13562 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
NEUROD1Q13562 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
NEUROD1Q13562 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
NEUROD1Q13562 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
NEUROD1Q13562 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
NEUROD1Q13562 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC33.64■■■□□ 2.98
NEUROD1Q13562 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
NEUROD1Q13562 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
NEUROD1Q13562 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
NEUROD1Q13562 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
NEUROD1Q13562 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC33.64■■■□□ 2.98
NEUROD1Q13562 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
NEUROD1Q13562 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
NEUROD1Q13562 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
NEUROD1Q13562 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
NEUROD1Q13562 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
NEUROD1Q13562 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
NEUROD1Q13562 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
NEUROD1Q13562 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
NEUROD1Q13562 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
NEUROD1Q13562 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
NEUROD1Q13562 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
NEUROD1Q13562 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
NEUROD1Q13562 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
NEUROD1Q13562 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
NEUROD1Q13562 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
NEUROD1Q13562 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
NEUROD1Q13562 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
NEUROD1Q13562 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC33.61■■■□□ 2.97
NEUROD1Q13562 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
NEUROD1Q13562 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
NEUROD1Q13562 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
NEUROD1Q13562 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
NEUROD1Q13562 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
NEUROD1Q13562 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
NEUROD1Q13562 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
NEUROD1Q13562 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
NEUROD1Q13562 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
NEUROD1Q13562 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
NEUROD1Q13562 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
NEUROD1Q13562 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
NEUROD1Q13562 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
NEUROD1Q13562 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
NEUROD1Q13562 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC33.59■■■□□ 2.97
NEUROD1Q13562 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
NEUROD1Q13562 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
NEUROD1Q13562 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC33.59■■■□□ 2.97
NEUROD1Q13562 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
NEUROD1Q13562 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
NEUROD1Q13562 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
NEUROD1Q13562 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
NEUROD1Q13562 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
NEUROD1Q13562 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
NEUROD1Q13562 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
NEUROD1Q13562 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
NEUROD1Q13562 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
NEUROD1Q13562 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
NEUROD1Q13562 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
NEUROD1Q13562 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC33.57■■■□□ 2.96
NEUROD1Q13562 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC33.57■■■□□ 2.96
NEUROD1Q13562 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC33.57■■■□□ 2.96
NEUROD1Q13562 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
NEUROD1Q13562 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
NEUROD1Q13562 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
NEUROD1Q13562 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
NEUROD1Q13562 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
NEUROD1Q13562 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
NEUROD1Q13562 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
NEUROD1Q13562 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
NEUROD1Q13562 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
NEUROD1Q13562 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
NEUROD1Q13562 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
NEUROD1Q13562 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
NEUROD1Q13562 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
NEUROD1Q13562 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
NEUROD1Q13562 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
NEUROD1Q13562 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
NEUROD1Q13562 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC33.54■■■□□ 2.96
NEUROD1Q13562 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
NEUROD1Q13562 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC33.54■■■□□ 2.96
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