Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ITGB3BPQ13352 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ITGB3BPQ13352 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ITGB3BPQ13352 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ITGB3BPQ13352 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ITGB3BPQ13352 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ITGB3BPQ13352 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ITGB3BPQ13352 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ITGB3BPQ13352 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ITGB3BPQ13352 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ITGB3BPQ13352 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ITGB3BPQ13352 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ITGB3BPQ13352 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ITGB3BPQ13352 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ITGB3BPQ13352 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ITGB3BPQ13352 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ITGB3BPQ13352 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ITGB3BPQ13352 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ITGB3BPQ13352 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ITGB3BPQ13352 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ITGB3BPQ13352 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ITGB3BPQ13352 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ITGB3BPQ13352 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ITGB3BPQ13352 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ITGB3BPQ13352 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ITGB3BPQ13352 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ITGB3BPQ13352 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ITGB3BPQ13352 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ITGB3BPQ13352 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ITGB3BPQ13352 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ITGB3BPQ13352 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ITGB3BPQ13352 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ITGB3BPQ13352 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ITGB3BPQ13352 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
ITGB3BPQ13352 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
ITGB3BPQ13352 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ITGB3BPQ13352 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ITGB3BPQ13352 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ITGB3BPQ13352 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ITGB3BPQ13352 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ITGB3BPQ13352 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ITGB3BPQ13352 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ITGB3BPQ13352 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ITGB3BPQ13352 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ITGB3BPQ13352 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ITGB3BPQ13352 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ITGB3BPQ13352 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ITGB3BPQ13352 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ITGB3BPQ13352 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ITGB3BPQ13352 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ITGB3BPQ13352 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ITGB3BPQ13352 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ITGB3BPQ13352 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ITGB3BPQ13352 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ITGB3BPQ13352 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ITGB3BPQ13352 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ITGB3BPQ13352 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ITGB3BPQ13352 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ITGB3BPQ13352 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ITGB3BPQ13352 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ITGB3BPQ13352 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
ITGB3BPQ13352 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ITGB3BPQ13352 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ITGB3BPQ13352 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ITGB3BPQ13352 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ITGB3BPQ13352 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ITGB3BPQ13352 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ITGB3BPQ13352 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ITGB3BPQ13352 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ITGB3BPQ13352 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ITGB3BPQ13352 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ITGB3BPQ13352 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ITGB3BPQ13352 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ITGB3BPQ13352 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ITGB3BPQ13352 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ITGB3BPQ13352 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ITGB3BPQ13352 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ITGB3BPQ13352 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ITGB3BPQ13352 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ITGB3BPQ13352 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ITGB3BPQ13352 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ITGB3BPQ13352 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ITGB3BPQ13352 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ITGB3BPQ13352 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ITGB3BPQ13352 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ITGB3BPQ13352 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ITGB3BPQ13352 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ITGB3BPQ13352 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.72
ITGB3BPQ13352 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ITGB3BPQ13352 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ITGB3BPQ13352 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ITGB3BPQ13352 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ITGB3BPQ13352 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ITGB3BPQ13352 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ITGB3BPQ13352 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ITGB3BPQ13352 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ITGB3BPQ13352 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ITGB3BPQ13352 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
ITGB3BPQ13352 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ITGB3BPQ13352 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
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