Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Length 867 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SP140Q13342 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SP140Q13342 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SP140Q13342 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SP140Q13342 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SP140Q13342 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SP140Q13342 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SP140Q13342 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SP140Q13342 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SP140Q13342 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SP140Q13342 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SP140Q13342 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SP140Q13342 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SP140Q13342 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SP140Q13342 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SP140Q13342 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SP140Q13342 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SP140Q13342 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SP140Q13342 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SP140Q13342 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SP140Q13342 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SP140Q13342 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SP140Q13342 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SP140Q13342 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SP140Q13342 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SP140Q13342 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SP140Q13342 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SP140Q13342 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SP140Q13342 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SP140Q13342 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SP140Q13342 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SP140Q13342 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SP140Q13342 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SP140Q13342 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SP140Q13342 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SP140Q13342 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SP140Q13342 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SP140Q13342 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SP140Q13342 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SP140Q13342 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SP140Q13342 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SP140Q13342 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SP140Q13342 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SP140Q13342 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SP140Q13342 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SP140Q13342 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SP140Q13342 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SP140Q13342 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SP140Q13342 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
SP140Q13342 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SP140Q13342 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SP140Q13342 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SP140Q13342 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SP140Q13342 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SP140Q13342 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SP140Q13342 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SP140Q13342 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SP140Q13342 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SP140Q13342 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SP140Q13342 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SP140Q13342 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SP140Q13342 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SP140Q13342 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SP140Q13342 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SP140Q13342 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SP140Q13342 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SP140Q13342 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SP140Q13342 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SP140Q13342 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SP140Q13342 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SP140Q13342 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SP140Q13342 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SP140Q13342 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SP140Q13342 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SP140Q13342 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SP140Q13342 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SP140Q13342 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SP140Q13342 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SP140Q13342 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SP140Q13342 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SP140Q13342 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SP140Q13342 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SP140Q13342 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SP140Q13342 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SP140Q13342 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SP140Q13342 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SP140Q13342 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SP140Q13342 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SP140Q13342 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SP140Q13342 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SP140Q13342 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SP140Q13342 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SP140Q13342 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SP140Q13342 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SP140Q13342 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SP140Q13342 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SP140Q13342 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SP140Q13342 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SP140Q13342 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SP140Q13342 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
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