Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CBX3Q13185 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CBX3Q13185 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CBX3Q13185 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CBX3Q13185 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CBX3Q13185 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CBX3Q13185 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CBX3Q13185 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CBX3Q13185 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CBX3Q13185 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CBX3Q13185 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CBX3Q13185 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CBX3Q13185 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CBX3Q13185 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CBX3Q13185 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CBX3Q13185 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CBX3Q13185 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CBX3Q13185 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CBX3Q13185 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CBX3Q13185 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CBX3Q13185 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CBX3Q13185 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CBX3Q13185 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CBX3Q13185 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CBX3Q13185 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CBX3Q13185 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CBX3Q13185 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CBX3Q13185 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CBX3Q13185 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CBX3Q13185 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CBX3Q13185 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CBX3Q13185 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CBX3Q13185 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CBX3Q13185 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CBX3Q13185 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CBX3Q13185 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CBX3Q13185 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CBX3Q13185 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CBX3Q13185 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CBX3Q13185 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CBX3Q13185 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CBX3Q13185 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CBX3Q13185 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CBX3Q13185 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CBX3Q13185 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CBX3Q13185 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CBX3Q13185 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CBX3Q13185 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CBX3Q13185 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CBX3Q13185 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CBX3Q13185 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CBX3Q13185 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CBX3Q13185 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
CBX3Q13185 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CBX3Q13185 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CBX3Q13185 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CBX3Q13185 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CBX3Q13185 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CBX3Q13185 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CBX3Q13185 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CBX3Q13185 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CBX3Q13185 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CBX3Q13185 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CBX3Q13185 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CBX3Q13185 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CBX3Q13185 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CBX3Q13185 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CBX3Q13185 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CBX3Q13185 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CBX3Q13185 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CBX3Q13185 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CBX3Q13185 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CBX3Q13185 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CBX3Q13185 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CBX3Q13185 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CBX3Q13185 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CBX3Q13185 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CBX3Q13185 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CBX3Q13185 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CBX3Q13185 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CBX3Q13185 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CBX3Q13185 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CBX3Q13185 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CBX3Q13185 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CBX3Q13185 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CBX3Q13185 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CBX3Q13185 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CBX3Q13185 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CBX3Q13185 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CBX3Q13185 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CBX3Q13185 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CBX3Q13185 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CBX3Q13185 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CBX3Q13185 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CBX3Q13185 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CBX3Q13185 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CBX3Q13185 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CBX3Q13185 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CBX3Q13185 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CBX3Q13185 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
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