Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRAF1Q13077 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRAF1Q13077 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRAF1Q13077 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRAF1Q13077 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRAF1Q13077 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRAF1Q13077 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRAF1Q13077 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRAF1Q13077 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRAF1Q13077 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRAF1Q13077 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRAF1Q13077 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRAF1Q13077 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
TRAF1Q13077 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRAF1Q13077 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRAF1Q13077 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRAF1Q13077 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRAF1Q13077 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRAF1Q13077 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRAF1Q13077 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRAF1Q13077 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRAF1Q13077 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRAF1Q13077 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRAF1Q13077 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRAF1Q13077 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRAF1Q13077 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
TRAF1Q13077 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRAF1Q13077 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRAF1Q13077 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRAF1Q13077 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRAF1Q13077 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRAF1Q13077 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRAF1Q13077 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRAF1Q13077 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRAF1Q13077 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRAF1Q13077 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRAF1Q13077 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRAF1Q13077 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRAF1Q13077 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
TRAF1Q13077 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRAF1Q13077 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRAF1Q13077 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRAF1Q13077 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRAF1Q13077 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRAF1Q13077 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRAF1Q13077 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRAF1Q13077 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRAF1Q13077 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRAF1Q13077 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRAF1Q13077 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRAF1Q13077 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRAF1Q13077 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRAF1Q13077 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRAF1Q13077 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRAF1Q13077 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRAF1Q13077 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRAF1Q13077 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRAF1Q13077 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
TRAF1Q13077 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRAF1Q13077 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRAF1Q13077 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRAF1Q13077 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRAF1Q13077 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRAF1Q13077 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRAF1Q13077 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRAF1Q13077 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRAF1Q13077 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRAF1Q13077 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRAF1Q13077 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRAF1Q13077 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRAF1Q13077 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRAF1Q13077 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
TRAF1Q13077 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
TRAF1Q13077 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRAF1Q13077 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRAF1Q13077 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRAF1Q13077 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRAF1Q13077 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRAF1Q13077 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TRAF1Q13077 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TRAF1Q13077 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TRAF1Q13077 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TRAF1Q13077 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TRAF1Q13077 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TRAF1Q13077 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TRAF1Q13077 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TRAF1Q13077 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRAF1Q13077 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRAF1Q13077 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRAF1Q13077 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRAF1Q13077 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRAF1Q13077 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRAF1Q13077 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRAF1Q13077 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRAF1Q13077 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRAF1Q13077 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRAF1Q13077 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRAF1Q13077 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
TRAF1Q13077 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRAF1Q13077 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
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