Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
GRIK2Q13002 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GRIK2Q13002 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GRIK2Q13002 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GRIK2Q13002 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GRIK2Q13002 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GRIK2Q13002 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GRIK2Q13002 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GRIK2Q13002 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GRIK2Q13002 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GRIK2Q13002 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GRIK2Q13002 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GRIK2Q13002 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GRIK2Q13002 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GRIK2Q13002 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
GRIK2Q13002 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GRIK2Q13002 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GRIK2Q13002 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
GRIK2Q13002 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
GRIK2Q13002 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GRIK2Q13002 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GRIK2Q13002 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
GRIK2Q13002 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GRIK2Q13002 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GRIK2Q13002 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GRIK2Q13002 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GRIK2Q13002 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
GRIK2Q13002 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GRIK2Q13002 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GRIK2Q13002 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GRIK2Q13002 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GRIK2Q13002 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GRIK2Q13002 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GRIK2Q13002 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GRIK2Q13002 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GRIK2Q13002 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GRIK2Q13002 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
GRIK2Q13002 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
GRIK2Q13002 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
GRIK2Q13002 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GRIK2Q13002 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GRIK2Q13002 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GRIK2Q13002 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GRIK2Q13002 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GRIK2Q13002 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GRIK2Q13002 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GRIK2Q13002 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GRIK2Q13002 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
GRIK2Q13002 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GRIK2Q13002 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GRIK2Q13002 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GRIK2Q13002 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GRIK2Q13002 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GRIK2Q13002 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GRIK2Q13002 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
GRIK2Q13002 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GRIK2Q13002 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GRIK2Q13002 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GRIK2Q13002 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GRIK2Q13002 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GRIK2Q13002 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GRIK2Q13002 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GRIK2Q13002 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GRIK2Q13002 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
GRIK2Q13002 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GRIK2Q13002 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GRIK2Q13002 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GRIK2Q13002 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GRIK2Q13002 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GRIK2Q13002 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GRIK2Q13002 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GRIK2Q13002 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GRIK2Q13002 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GRIK2Q13002 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GRIK2Q13002 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GRIK2Q13002 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
GRIK2Q13002 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GRIK2Q13002 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GRIK2Q13002 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
GRIK2Q13002 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GRIK2Q13002 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GRIK2Q13002 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GRIK2Q13002 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GRIK2Q13002 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GRIK2Q13002 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GRIK2Q13002 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GRIK2Q13002 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GRIK2Q13002 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GRIK2Q13002 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GRIK2Q13002 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GRIK2Q13002 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GRIK2Q13002 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GRIK2Q13002 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GRIK2Q13002 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GRIK2Q13002 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GRIK2Q13002 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GRIK2Q13002 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GRIK2Q13002 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GRIK2Q13002 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GRIK2Q13002 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
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