Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPN13Q12923 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPN13Q12923 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPN13Q12923 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPN13Q12923 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPN13Q12923 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPN13Q12923 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPN13Q12923 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPN13Q12923 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPN13Q12923 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPN13Q12923 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPN13Q12923 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPN13Q12923 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPN13Q12923 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPN13Q12923 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPN13Q12923 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPN13Q12923 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPN13Q12923 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPN13Q12923 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPN13Q12923 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPN13Q12923 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPN13Q12923 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPN13Q12923 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPN13Q12923 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPN13Q12923 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPN13Q12923 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPN13Q12923 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPN13Q12923 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPN13Q12923 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPN13Q12923 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPN13Q12923 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPN13Q12923 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPN13Q12923 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPN13Q12923 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPN13Q12923 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPN13Q12923 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPN13Q12923 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPN13Q12923 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPN13Q12923 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPN13Q12923 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPN13Q12923 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPN13Q12923 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPN13Q12923 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPN13Q12923 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPN13Q12923 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPN13Q12923 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPN13Q12923 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPN13Q12923 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPN13Q12923 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PTPN13Q12923 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
PTPN13Q12923 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPN13Q12923 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPN13Q12923 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPN13Q12923 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPN13Q12923 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPN13Q12923 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPN13Q12923 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPN13Q12923 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPN13Q12923 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPN13Q12923 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPN13Q12923 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPN13Q12923 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPN13Q12923 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPN13Q12923 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPN13Q12923 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPN13Q12923 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPN13Q12923 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPN13Q12923 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPN13Q12923 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPN13Q12923 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPN13Q12923 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPN13Q12923 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPN13Q12923 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPN13Q12923 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPN13Q12923 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPN13Q12923 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPN13Q12923 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPN13Q12923 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPN13Q12923 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPN13Q12923 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPN13Q12923 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPN13Q12923 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPN13Q12923 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPN13Q12923 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPN13Q12923 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPN13Q12923 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPN13Q12923 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPN13Q12923 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPN13Q12923 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPN13Q12923 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPN13Q12923 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPN13Q12923 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPN13Q12923 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPN13Q12923 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPN13Q12923 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPN13Q12923 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPN13Q12923 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPN13Q12923 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPN13Q12923 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPN13Q12923 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
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