Protein–RNA interactions for Protein: Q0VFZ6

CCDC173, Coiled-coil domain-containing protein 173, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC173Q0VFZ6 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC173Q0VFZ6 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC173Q0VFZ6 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC173Q0VFZ6 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC173Q0VFZ6 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC173Q0VFZ6 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC173Q0VFZ6 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC173Q0VFZ6 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC173Q0VFZ6 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC173Q0VFZ6 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC173Q0VFZ6 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC173Q0VFZ6 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
CCDC173Q0VFZ6 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC173Q0VFZ6 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC173Q0VFZ6 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC173Q0VFZ6 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC173Q0VFZ6 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC173Q0VFZ6 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC173Q0VFZ6 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC173Q0VFZ6 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC173Q0VFZ6 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC173Q0VFZ6 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC173Q0VFZ6 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC173Q0VFZ6 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC173Q0VFZ6 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC173Q0VFZ6 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC173Q0VFZ6 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC173Q0VFZ6 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC173Q0VFZ6 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC173Q0VFZ6 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC173Q0VFZ6 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC173Q0VFZ6 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC173Q0VFZ6 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC173Q0VFZ6 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC173Q0VFZ6 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC173Q0VFZ6 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC173Q0VFZ6 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC173Q0VFZ6 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC173Q0VFZ6 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC173Q0VFZ6 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC173Q0VFZ6 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC173Q0VFZ6 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC173Q0VFZ6 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC173Q0VFZ6 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC173Q0VFZ6 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC173Q0VFZ6 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC173Q0VFZ6 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC173Q0VFZ6 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC173Q0VFZ6 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC173Q0VFZ6 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC173Q0VFZ6 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC173Q0VFZ6 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC173Q0VFZ6 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC173Q0VFZ6 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC173Q0VFZ6 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC173Q0VFZ6 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC173Q0VFZ6 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC173Q0VFZ6 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC173Q0VFZ6 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC173Q0VFZ6 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC173Q0VFZ6 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC173Q0VFZ6 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC173Q0VFZ6 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC173Q0VFZ6 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC173Q0VFZ6 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC173Q0VFZ6 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC173Q0VFZ6 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC173Q0VFZ6 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC173Q0VFZ6 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC173Q0VFZ6 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC173Q0VFZ6 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC173Q0VFZ6 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC173Q0VFZ6 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC173Q0VFZ6 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC173Q0VFZ6 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC173Q0VFZ6 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC173Q0VFZ6 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC173Q0VFZ6 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC173Q0VFZ6 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC173Q0VFZ6 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC173Q0VFZ6 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC173Q0VFZ6 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC173Q0VFZ6 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC173Q0VFZ6 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC173Q0VFZ6 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC173Q0VFZ6 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC173Q0VFZ6 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC173Q0VFZ6 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC173Q0VFZ6 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC173Q0VFZ6 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC173Q0VFZ6 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC173Q0VFZ6 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC173Q0VFZ6 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC173Q0VFZ6 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC173Q0VFZ6 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC173Q0VFZ6 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC173Q0VFZ6 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC173Q0VFZ6 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC173Q0VFZ6 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC173Q0VFZ6 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms