Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
APOBRQ0VD83 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
APOBRQ0VD83 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
APOBRQ0VD83 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
APOBRQ0VD83 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
APOBRQ0VD83 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
APOBRQ0VD83 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
APOBRQ0VD83 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
APOBRQ0VD83 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
APOBRQ0VD83 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
APOBRQ0VD83 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
APOBRQ0VD83 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
APOBRQ0VD83 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
APOBRQ0VD83 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
APOBRQ0VD83 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
APOBRQ0VD83 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
APOBRQ0VD83 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
APOBRQ0VD83 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
APOBRQ0VD83 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
APOBRQ0VD83 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
APOBRQ0VD83 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
APOBRQ0VD83 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
APOBRQ0VD83 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
APOBRQ0VD83 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
APOBRQ0VD83 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
APOBRQ0VD83 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
APOBRQ0VD83 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
APOBRQ0VD83 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
APOBRQ0VD83 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
APOBRQ0VD83 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
APOBRQ0VD83 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
APOBRQ0VD83 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
APOBRQ0VD83 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
APOBRQ0VD83 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
APOBRQ0VD83 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
APOBRQ0VD83 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
APOBRQ0VD83 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
APOBRQ0VD83 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
APOBRQ0VD83 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
APOBRQ0VD83 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
APOBRQ0VD83 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
APOBRQ0VD83 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
APOBRQ0VD83 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
APOBRQ0VD83 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
APOBRQ0VD83 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
APOBRQ0VD83 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
APOBRQ0VD83 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
APOBRQ0VD83 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
APOBRQ0VD83 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
APOBRQ0VD83 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
APOBRQ0VD83 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
APOBRQ0VD83 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
APOBRQ0VD83 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
APOBRQ0VD83 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
APOBRQ0VD83 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
APOBRQ0VD83 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
APOBRQ0VD83 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
APOBRQ0VD83 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
APOBRQ0VD83 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
APOBRQ0VD83 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
APOBRQ0VD83 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
APOBRQ0VD83 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
APOBRQ0VD83 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
APOBRQ0VD83 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
APOBRQ0VD83 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
APOBRQ0VD83 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
APOBRQ0VD83 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
APOBRQ0VD83 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
APOBRQ0VD83 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
APOBRQ0VD83 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
APOBRQ0VD83 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
APOBRQ0VD83 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
APOBRQ0VD83 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
APOBRQ0VD83 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
APOBRQ0VD83 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
APOBRQ0VD83 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
APOBRQ0VD83 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
APOBRQ0VD83 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
APOBRQ0VD83 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
APOBRQ0VD83 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
APOBRQ0VD83 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
APOBRQ0VD83 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
APOBRQ0VD83 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
APOBRQ0VD83 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
APOBRQ0VD83 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
APOBRQ0VD83 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
APOBRQ0VD83 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
APOBRQ0VD83 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
APOBRQ0VD83 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
APOBRQ0VD83 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
APOBRQ0VD83 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
APOBRQ0VD83 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
APOBRQ0VD83 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
APOBRQ0VD83 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
APOBRQ0VD83 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
APOBRQ0VD83 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
APOBRQ0VD83 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
APOBRQ0VD83 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
APOBRQ0VD83 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
APOBRQ0VD83 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms