Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAQ4

SMAGP, Small cell adhesion glycoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAGPQ0VAQ4 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMAGPQ0VAQ4 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMAGPQ0VAQ4 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMAGPQ0VAQ4 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMAGPQ0VAQ4 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMAGPQ0VAQ4 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SMAGPQ0VAQ4 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SMAGPQ0VAQ4 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SMAGPQ0VAQ4 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SMAGPQ0VAQ4 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMAGPQ0VAQ4 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMAGPQ0VAQ4 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMAGPQ0VAQ4 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMAGPQ0VAQ4 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SMAGPQ0VAQ4 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMAGPQ0VAQ4 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMAGPQ0VAQ4 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMAGPQ0VAQ4 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMAGPQ0VAQ4 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMAGPQ0VAQ4 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMAGPQ0VAQ4 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMAGPQ0VAQ4 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMAGPQ0VAQ4 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMAGPQ0VAQ4 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMAGPQ0VAQ4 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMAGPQ0VAQ4 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMAGPQ0VAQ4 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMAGPQ0VAQ4 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMAGPQ0VAQ4 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMAGPQ0VAQ4 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMAGPQ0VAQ4 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMAGPQ0VAQ4 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMAGPQ0VAQ4 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMAGPQ0VAQ4 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMAGPQ0VAQ4 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMAGPQ0VAQ4 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMAGPQ0VAQ4 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMAGPQ0VAQ4 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMAGPQ0VAQ4 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMAGPQ0VAQ4 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMAGPQ0VAQ4 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMAGPQ0VAQ4 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMAGPQ0VAQ4 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMAGPQ0VAQ4 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMAGPQ0VAQ4 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMAGPQ0VAQ4 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMAGPQ0VAQ4 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMAGPQ0VAQ4 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMAGPQ0VAQ4 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMAGPQ0VAQ4 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMAGPQ0VAQ4 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMAGPQ0VAQ4 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMAGPQ0VAQ4 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMAGPQ0VAQ4 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMAGPQ0VAQ4 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMAGPQ0VAQ4 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMAGPQ0VAQ4 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMAGPQ0VAQ4 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMAGPQ0VAQ4 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMAGPQ0VAQ4 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMAGPQ0VAQ4 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMAGPQ0VAQ4 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMAGPQ0VAQ4 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMAGPQ0VAQ4 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMAGPQ0VAQ4 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMAGPQ0VAQ4 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMAGPQ0VAQ4 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMAGPQ0VAQ4 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMAGPQ0VAQ4 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMAGPQ0VAQ4 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMAGPQ0VAQ4 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMAGPQ0VAQ4 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMAGPQ0VAQ4 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMAGPQ0VAQ4 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SMAGPQ0VAQ4 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMAGPQ0VAQ4 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMAGPQ0VAQ4 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMAGPQ0VAQ4 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMAGPQ0VAQ4 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMAGPQ0VAQ4 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMAGPQ0VAQ4 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMAGPQ0VAQ4 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMAGPQ0VAQ4 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMAGPQ0VAQ4 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMAGPQ0VAQ4 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMAGPQ0VAQ4 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMAGPQ0VAQ4 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMAGPQ0VAQ4 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMAGPQ0VAQ4 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMAGPQ0VAQ4 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SMAGPQ0VAQ4 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMAGPQ0VAQ4 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMAGPQ0VAQ4 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMAGPQ0VAQ4 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMAGPQ0VAQ4 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMAGPQ0VAQ4 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMAGPQ0VAQ4 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMAGPQ0VAQ4 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMAGPQ0VAQ4 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SMAGPQ0VAQ4 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.4 ms