Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
IFFO1Q0D2I5 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
IFFO1Q0D2I5 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IFFO1Q0D2I5 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IFFO1Q0D2I5 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
IFFO1Q0D2I5 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IFFO1Q0D2I5 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IFFO1Q0D2I5 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
IFFO1Q0D2I5 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
IFFO1Q0D2I5 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IFFO1Q0D2I5 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
IFFO1Q0D2I5 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IFFO1Q0D2I5 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IFFO1Q0D2I5 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
IFFO1Q0D2I5 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
IFFO1Q0D2I5 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
IFFO1Q0D2I5 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IFFO1Q0D2I5 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IFFO1Q0D2I5 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IFFO1Q0D2I5 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IFFO1Q0D2I5 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IFFO1Q0D2I5 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IFFO1Q0D2I5 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IFFO1Q0D2I5 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IFFO1Q0D2I5 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IFFO1Q0D2I5 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IFFO1Q0D2I5 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
IFFO1Q0D2I5 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IFFO1Q0D2I5 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IFFO1Q0D2I5 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
IFFO1Q0D2I5 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IFFO1Q0D2I5 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
IFFO1Q0D2I5 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
IFFO1Q0D2I5 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IFFO1Q0D2I5 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IFFO1Q0D2I5 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
IFFO1Q0D2I5 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IFFO1Q0D2I5 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IFFO1Q0D2I5 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IFFO1Q0D2I5 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IFFO1Q0D2I5 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
IFFO1Q0D2I5 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
IFFO1Q0D2I5 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
IFFO1Q0D2I5 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
IFFO1Q0D2I5 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
IFFO1Q0D2I5 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
IFFO1Q0D2I5 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IFFO1Q0D2I5 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IFFO1Q0D2I5 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IFFO1Q0D2I5 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IFFO1Q0D2I5 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
IFFO1Q0D2I5 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
IFFO1Q0D2I5 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IFFO1Q0D2I5 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IFFO1Q0D2I5 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IFFO1Q0D2I5 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IFFO1Q0D2I5 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IFFO1Q0D2I5 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IFFO1Q0D2I5 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
IFFO1Q0D2I5 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IFFO1Q0D2I5 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
IFFO1Q0D2I5 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IFFO1Q0D2I5 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
IFFO1Q0D2I5 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
IFFO1Q0D2I5 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
IFFO1Q0D2I5 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
IFFO1Q0D2I5 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
IFFO1Q0D2I5 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IFFO1Q0D2I5 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IFFO1Q0D2I5 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IFFO1Q0D2I5 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
IFFO1Q0D2I5 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
IFFO1Q0D2I5 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IFFO1Q0D2I5 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IFFO1Q0D2I5 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IFFO1Q0D2I5 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IFFO1Q0D2I5 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IFFO1Q0D2I5 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IFFO1Q0D2I5 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IFFO1Q0D2I5 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IFFO1Q0D2I5 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IFFO1Q0D2I5 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
IFFO1Q0D2I5 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
IFFO1Q0D2I5 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
IFFO1Q0D2I5 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
IFFO1Q0D2I5 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
IFFO1Q0D2I5 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
IFFO1Q0D2I5 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
IFFO1Q0D2I5 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
IFFO1Q0D2I5 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
IFFO1Q0D2I5 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
IFFO1Q0D2I5 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
IFFO1Q0D2I5 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
IFFO1Q0D2I5 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
IFFO1Q0D2I5 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IFFO1Q0D2I5 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IFFO1Q0D2I5 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
IFFO1Q0D2I5 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
IFFO1Q0D2I5 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IFFO1Q0D2I5 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms