Protein–RNA interactions for Protein: Q08ER8

ZNF543, Zinc finger protein 543, humanhuman

Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF543Q08ER8 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ZNF543Q08ER8 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ZNF543Q08ER8 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ZNF543Q08ER8 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ZNF543Q08ER8 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ZNF543Q08ER8 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ZNF543Q08ER8 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ZNF543Q08ER8 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
ZNF543Q08ER8 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ZNF543Q08ER8 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ZNF543Q08ER8 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ZNF543Q08ER8 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ZNF543Q08ER8 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ZNF543Q08ER8 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ZNF543Q08ER8 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ZNF543Q08ER8 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ZNF543Q08ER8 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ZNF543Q08ER8 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ZNF543Q08ER8 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ZNF543Q08ER8 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ZNF543Q08ER8 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ZNF543Q08ER8 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ZNF543Q08ER8 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ZNF543Q08ER8 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ZNF543Q08ER8 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ZNF543Q08ER8 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ZNF543Q08ER8 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ZNF543Q08ER8 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ZNF543Q08ER8 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ZNF543Q08ER8 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ZNF543Q08ER8 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ZNF543Q08ER8 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ZNF543Q08ER8 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ZNF543Q08ER8 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ZNF543Q08ER8 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ZNF543Q08ER8 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ZNF543Q08ER8 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
ZNF543Q08ER8 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
ZNF543Q08ER8 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ZNF543Q08ER8 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ZNF543Q08ER8 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ZNF543Q08ER8 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ZNF543Q08ER8 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ZNF543Q08ER8 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ZNF543Q08ER8 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ZNF543Q08ER8 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ZNF543Q08ER8 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ZNF543Q08ER8 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ZNF543Q08ER8 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ZNF543Q08ER8 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ZNF543Q08ER8 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ZNF543Q08ER8 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ZNF543Q08ER8 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ZNF543Q08ER8 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ZNF543Q08ER8 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ZNF543Q08ER8 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ZNF543Q08ER8 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ZNF543Q08ER8 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ZNF543Q08ER8 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ZNF543Q08ER8 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ZNF543Q08ER8 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ZNF543Q08ER8 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
ZNF543Q08ER8 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ZNF543Q08ER8 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
ZNF543Q08ER8 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ZNF543Q08ER8 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ZNF543Q08ER8 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ZNF543Q08ER8 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ZNF543Q08ER8 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ZNF543Q08ER8 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.84
ZNF543Q08ER8 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ZNF543Q08ER8 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ZNF543Q08ER8 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ZNF543Q08ER8 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ZNF543Q08ER8 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ZNF543Q08ER8 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ZNF543Q08ER8 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ZNF543Q08ER8 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ZNF543Q08ER8 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ZNF543Q08ER8 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ZNF543Q08ER8 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ZNF543Q08ER8 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ZNF543Q08ER8 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ZNF543Q08ER8 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ZNF543Q08ER8 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ZNF543Q08ER8 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ZNF543Q08ER8 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ZNF543Q08ER8 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ZNF543Q08ER8 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ZNF543Q08ER8 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ZNF543Q08ER8 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ZNF543Q08ER8 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ZNF543Q08ER8 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ZNF543Q08ER8 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ZNF543Q08ER8 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ZNF543Q08ER8 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ZNF543Q08ER8 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ZNF543Q08ER8 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ZNF543Q08ER8 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ZNF543Q08ER8 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms