Protein–RNA interactions for Protein: Q08493

PDE4C, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4C, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4CQ08493 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDE4CQ08493 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDE4CQ08493 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDE4CQ08493 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDE4CQ08493 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDE4CQ08493 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDE4CQ08493 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDE4CQ08493 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDE4CQ08493 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDE4CQ08493 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDE4CQ08493 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDE4CQ08493 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDE4CQ08493 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDE4CQ08493 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDE4CQ08493 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDE4CQ08493 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDE4CQ08493 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PDE4CQ08493 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDE4CQ08493 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDE4CQ08493 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDE4CQ08493 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PDE4CQ08493 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PDE4CQ08493 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PDE4CQ08493 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PDE4CQ08493 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PDE4CQ08493 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PDE4CQ08493 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
PDE4CQ08493 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PDE4CQ08493 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PDE4CQ08493 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PDE4CQ08493 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDE4CQ08493 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDE4CQ08493 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDE4CQ08493 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDE4CQ08493 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDE4CQ08493 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDE4CQ08493 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDE4CQ08493 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PDE4CQ08493 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDE4CQ08493 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDE4CQ08493 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDE4CQ08493 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDE4CQ08493 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDE4CQ08493 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDE4CQ08493 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDE4CQ08493 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDE4CQ08493 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDE4CQ08493 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PDE4CQ08493 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PDE4CQ08493 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PDE4CQ08493 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PDE4CQ08493 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PDE4CQ08493 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PDE4CQ08493 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDE4CQ08493 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDE4CQ08493 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDE4CQ08493 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDE4CQ08493 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDE4CQ08493 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDE4CQ08493 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDE4CQ08493 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDE4CQ08493 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDE4CQ08493 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDE4CQ08493 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDE4CQ08493 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDE4CQ08493 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDE4CQ08493 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDE4CQ08493 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDE4CQ08493 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDE4CQ08493 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDE4CQ08493 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDE4CQ08493 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDE4CQ08493 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDE4CQ08493 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDE4CQ08493 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDE4CQ08493 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDE4CQ08493 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDE4CQ08493 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDE4CQ08493 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDE4CQ08493 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDE4CQ08493 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDE4CQ08493 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDE4CQ08493 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDE4CQ08493 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PDE4CQ08493 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDE4CQ08493 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDE4CQ08493 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDE4CQ08493 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDE4CQ08493 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PDE4CQ08493 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PDE4CQ08493 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PDE4CQ08493 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PDE4CQ08493 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PDE4CQ08493 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDE4CQ08493 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDE4CQ08493 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDE4CQ08493 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PDE4CQ08493 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDE4CQ08493 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDE4CQ08493 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms