Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SRSF4Q08170 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SRSF4Q08170 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SRSF4Q08170 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SRSF4Q08170 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SRSF4Q08170 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SRSF4Q08170 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SRSF4Q08170 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SRSF4Q08170 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SRSF4Q08170 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SRSF4Q08170 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SRSF4Q08170 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SRSF4Q08170 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SRSF4Q08170 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SRSF4Q08170 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SRSF4Q08170 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
SRSF4Q08170 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SRSF4Q08170 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SRSF4Q08170 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SRSF4Q08170 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
SRSF4Q08170 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SRSF4Q08170 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SRSF4Q08170 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SRSF4Q08170 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SRSF4Q08170 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SRSF4Q08170 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SRSF4Q08170 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SRSF4Q08170 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SRSF4Q08170 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SRSF4Q08170 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SRSF4Q08170 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SRSF4Q08170 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SRSF4Q08170 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SRSF4Q08170 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SRSF4Q08170 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SRSF4Q08170 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SRSF4Q08170 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SRSF4Q08170 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SRSF4Q08170 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SRSF4Q08170 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SRSF4Q08170 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SRSF4Q08170 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SRSF4Q08170 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SRSF4Q08170 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SRSF4Q08170 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SRSF4Q08170 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SRSF4Q08170 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SRSF4Q08170 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SRSF4Q08170 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SRSF4Q08170 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SRSF4Q08170 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SRSF4Q08170 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SRSF4Q08170 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SRSF4Q08170 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SRSF4Q08170 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SRSF4Q08170 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SRSF4Q08170 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SRSF4Q08170 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SRSF4Q08170 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SRSF4Q08170 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SRSF4Q08170 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SRSF4Q08170 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SRSF4Q08170 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SRSF4Q08170 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SRSF4Q08170 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SRSF4Q08170 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SRSF4Q08170 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SRSF4Q08170 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SRSF4Q08170 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SRSF4Q08170 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SRSF4Q08170 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SRSF4Q08170 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SRSF4Q08170 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SRSF4Q08170 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SRSF4Q08170 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SRSF4Q08170 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SRSF4Q08170 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SRSF4Q08170 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SRSF4Q08170 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SRSF4Q08170 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SRSF4Q08170 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SRSF4Q08170 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SRSF4Q08170 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SRSF4Q08170 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SRSF4Q08170 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SRSF4Q08170 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SRSF4Q08170 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SRSF4Q08170 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SRSF4Q08170 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SRSF4Q08170 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SRSF4Q08170 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SRSF4Q08170 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SRSF4Q08170 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SRSF4Q08170 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SRSF4Q08170 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SRSF4Q08170 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SRSF4Q08170 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SRSF4Q08170 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SRSF4Q08170 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SRSF4Q08170 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms