Protein–RNA interactions for Protein: Q07912

TNK2, Activated CDC42 kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,038 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNK2Q07912 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
TNK2Q07912 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TNK2Q07912 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TNK2Q07912 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TNK2Q07912 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
TNK2Q07912 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TNK2Q07912 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
TNK2Q07912 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
TNK2Q07912 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TNK2Q07912 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TNK2Q07912 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TNK2Q07912 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TNK2Q07912 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TNK2Q07912 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TNK2Q07912 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TNK2Q07912 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TNK2Q07912 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TNK2Q07912 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TNK2Q07912 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TNK2Q07912 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TNK2Q07912 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TNK2Q07912 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
TNK2Q07912 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TNK2Q07912 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TNK2Q07912 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TNK2Q07912 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TNK2Q07912 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TNK2Q07912 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TNK2Q07912 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TNK2Q07912 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TNK2Q07912 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TNK2Q07912 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TNK2Q07912 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TNK2Q07912 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TNK2Q07912 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TNK2Q07912 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TNK2Q07912 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TNK2Q07912 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TNK2Q07912 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TNK2Q07912 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TNK2Q07912 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TNK2Q07912 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TNK2Q07912 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TNK2Q07912 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TNK2Q07912 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TNK2Q07912 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
TNK2Q07912 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TNK2Q07912 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TNK2Q07912 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TNK2Q07912 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TNK2Q07912 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
TNK2Q07912 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TNK2Q07912 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TNK2Q07912 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TNK2Q07912 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TNK2Q07912 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TNK2Q07912 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TNK2Q07912 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TNK2Q07912 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TNK2Q07912 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TNK2Q07912 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TNK2Q07912 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TNK2Q07912 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TNK2Q07912 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TNK2Q07912 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TNK2Q07912 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TNK2Q07912 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TNK2Q07912 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TNK2Q07912 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TNK2Q07912 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TNK2Q07912 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TNK2Q07912 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TNK2Q07912 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TNK2Q07912 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
TNK2Q07912 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TNK2Q07912 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TNK2Q07912 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TNK2Q07912 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TNK2Q07912 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TNK2Q07912 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TNK2Q07912 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TNK2Q07912 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TNK2Q07912 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TNK2Q07912 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TNK2Q07912 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TNK2Q07912 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TNK2Q07912 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TNK2Q07912 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
TNK2Q07912 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TNK2Q07912 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TNK2Q07912 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TNK2Q07912 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TNK2Q07912 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TNK2Q07912 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TNK2Q07912 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TNK2Q07912 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TNK2Q07912 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TNK2Q07912 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TNK2Q07912 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TNK2Q07912 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms