Protein–RNA interactions for Protein: Q07325

CXCL9, C-X-C motif chemokine 9, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL9Q07325 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CXCL9Q07325 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CXCL9Q07325 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CXCL9Q07325 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CXCL9Q07325 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CXCL9Q07325 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CXCL9Q07325 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CXCL9Q07325 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CXCL9Q07325 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CXCL9Q07325 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
CXCL9Q07325 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CXCL9Q07325 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CXCL9Q07325 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CXCL9Q07325 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CXCL9Q07325 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CXCL9Q07325 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
CXCL9Q07325 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CXCL9Q07325 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CXCL9Q07325 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CXCL9Q07325 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CXCL9Q07325 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CXCL9Q07325 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CXCL9Q07325 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
CXCL9Q07325 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CXCL9Q07325 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CXCL9Q07325 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CXCL9Q07325 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CXCL9Q07325 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CXCL9Q07325 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CXCL9Q07325 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CXCL9Q07325 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CXCL9Q07325 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CXCL9Q07325 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
CXCL9Q07325 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CXCL9Q07325 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CXCL9Q07325 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CXCL9Q07325 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CXCL9Q07325 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CXCL9Q07325 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CXCL9Q07325 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CXCL9Q07325 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CXCL9Q07325 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CXCL9Q07325 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CXCL9Q07325 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CXCL9Q07325 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CXCL9Q07325 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
CXCL9Q07325 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
CXCL9Q07325 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CXCL9Q07325 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CXCL9Q07325 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CXCL9Q07325 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CXCL9Q07325 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CXCL9Q07325 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CXCL9Q07325 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CXCL9Q07325 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CXCL9Q07325 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CXCL9Q07325 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
CXCL9Q07325 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
CXCL9Q07325 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
CXCL9Q07325 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CXCL9Q07325 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CXCL9Q07325 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CXCL9Q07325 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CXCL9Q07325 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CXCL9Q07325 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CXCL9Q07325 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CXCL9Q07325 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CXCL9Q07325 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CXCL9Q07325 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
CXCL9Q07325 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CXCL9Q07325 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CXCL9Q07325 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CXCL9Q07325 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
CXCL9Q07325 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CXCL9Q07325 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CXCL9Q07325 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CXCL9Q07325 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CXCL9Q07325 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CXCL9Q07325 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
CXCL9Q07325 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CXCL9Q07325 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
CXCL9Q07325 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
CXCL9Q07325 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
CXCL9Q07325 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
CXCL9Q07325 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
CXCL9Q07325 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
CXCL9Q07325 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CXCL9Q07325 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CXCL9Q07325 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CXCL9Q07325 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CXCL9Q07325 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
CXCL9Q07325 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CXCL9Q07325 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CXCL9Q07325 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CXCL9Q07325 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CXCL9Q07325 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CXCL9Q07325 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CXCL9Q07325 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CXCL9Q07325 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CXCL9Q07325 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms