Protein–RNA interactions for Protein: Q07002

CDK18, Cyclin-dependent kinase 18, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK18Q07002 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDK18Q07002 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDK18Q07002 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDK18Q07002 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDK18Q07002 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDK18Q07002 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDK18Q07002 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDK18Q07002 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDK18Q07002 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CDK18Q07002 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CDK18Q07002 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDK18Q07002 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDK18Q07002 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDK18Q07002 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CDK18Q07002 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDK18Q07002 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDK18Q07002 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDK18Q07002 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDK18Q07002 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDK18Q07002 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDK18Q07002 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDK18Q07002 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDK18Q07002 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDK18Q07002 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDK18Q07002 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDK18Q07002 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDK18Q07002 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDK18Q07002 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDK18Q07002 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CDK18Q07002 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDK18Q07002 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDK18Q07002 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDK18Q07002 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDK18Q07002 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDK18Q07002 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDK18Q07002 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDK18Q07002 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDK18Q07002 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDK18Q07002 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDK18Q07002 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDK18Q07002 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDK18Q07002 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDK18Q07002 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDK18Q07002 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDK18Q07002 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDK18Q07002 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDK18Q07002 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDK18Q07002 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDK18Q07002 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDK18Q07002 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDK18Q07002 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDK18Q07002 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDK18Q07002 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDK18Q07002 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDK18Q07002 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDK18Q07002 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDK18Q07002 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDK18Q07002 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDK18Q07002 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDK18Q07002 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDK18Q07002 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDK18Q07002 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDK18Q07002 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDK18Q07002 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDK18Q07002 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CDK18Q07002 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDK18Q07002 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDK18Q07002 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDK18Q07002 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CDK18Q07002 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDK18Q07002 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDK18Q07002 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDK18Q07002 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDK18Q07002 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDK18Q07002 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDK18Q07002 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDK18Q07002 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDK18Q07002 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDK18Q07002 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDK18Q07002 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDK18Q07002 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDK18Q07002 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDK18Q07002 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDK18Q07002 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDK18Q07002 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDK18Q07002 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDK18Q07002 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDK18Q07002 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CDK18Q07002 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDK18Q07002 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDK18Q07002 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDK18Q07002 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CDK18Q07002 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDK18Q07002 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDK18Q07002 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDK18Q07002 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDK18Q07002 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDK18Q07002 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDK18Q07002 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDK18Q07002 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71 ms