Protein–RNA interactions for Protein: Q06828

FMOD, Fibromodulin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMODQ06828 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FMODQ06828 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FMODQ06828 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FMODQ06828 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FMODQ06828 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FMODQ06828 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FMODQ06828 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FMODQ06828 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FMODQ06828 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
FMODQ06828 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FMODQ06828 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FMODQ06828 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FMODQ06828 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FMODQ06828 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FMODQ06828 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FMODQ06828 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
FMODQ06828 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
FMODQ06828 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
FMODQ06828 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FMODQ06828 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FMODQ06828 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FMODQ06828 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FMODQ06828 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FMODQ06828 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FMODQ06828 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FMODQ06828 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FMODQ06828 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FMODQ06828 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FMODQ06828 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FMODQ06828 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FMODQ06828 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FMODQ06828 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FMODQ06828 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FMODQ06828 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FMODQ06828 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FMODQ06828 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FMODQ06828 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FMODQ06828 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FMODQ06828 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FMODQ06828 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FMODQ06828 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FMODQ06828 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FMODQ06828 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FMODQ06828 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FMODQ06828 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FMODQ06828 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FMODQ06828 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FMODQ06828 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FMODQ06828 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FMODQ06828 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FMODQ06828 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FMODQ06828 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FMODQ06828 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FMODQ06828 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FMODQ06828 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FMODQ06828 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FMODQ06828 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
FMODQ06828 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
FMODQ06828 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
FMODQ06828 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FMODQ06828 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FMODQ06828 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
FMODQ06828 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FMODQ06828 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
FMODQ06828 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
FMODQ06828 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FMODQ06828 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FMODQ06828 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
FMODQ06828 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FMODQ06828 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
FMODQ06828 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
FMODQ06828 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FMODQ06828 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FMODQ06828 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FMODQ06828 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FMODQ06828 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FMODQ06828 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FMODQ06828 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FMODQ06828 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FMODQ06828 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FMODQ06828 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FMODQ06828 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FMODQ06828 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FMODQ06828 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FMODQ06828 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FMODQ06828 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FMODQ06828 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FMODQ06828 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FMODQ06828 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FMODQ06828 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FMODQ06828 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FMODQ06828 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FMODQ06828 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
FMODQ06828 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FMODQ06828 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FMODQ06828 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FMODQ06828 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FMODQ06828 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FMODQ06828 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FMODQ06828 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.5 ms