Protein–RNA interactions for Protein: Q06787

FMR1, Synaptic functional regulator FMR1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 632 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMR1Q06787 SLC25A17-209ENST00000434193 598 ntTSL 410.89□□□□□ -0.674e-8■■■■■ 28.8
FMR1Q06787 SLC25A17-207ENST00000430221 734 ntTSL 410.84□□□□□ -0.674e-8■■■■■ 28.8
FMR1Q06787 MICAL2-203ENST00000379612 6625 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.691e-7■■■■■ 28.8
FMR1Q06787 AC015574.1-201ENST00000615194 489 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.714e-8■■■■■ 28.8
FMR1Q06787 SLC25A17-216ENST00000491545 2530 ntTSL 1 (best)10.31□□□□□ -0.764e-8■■■■■ 28.8
FMR1Q06787 MICAL2-221ENST00000530691 6307 ntTSL 1 (best)10.21□□□□□ -0.771e-7■■■■■ 28.8
FMR1Q06787 MICAL2-202ENST00000342902 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.81e-7■■■■■ 28.8
FMR1Q06787 DNAH14-211ENST00000445597 10524 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.82e-7■■■■■ 28.8
FMR1Q06787 SLC25A17-212ENST00000447566 1243 ntTSL 59.45□□□□□ -0.94e-8■■■■■ 28.8
FMR1Q06787 RFWD2-206ENST00000461830 2131 ntTSL 58.8□□□□□ -14e-8■■■■■ 28.8
FMR1Q06787 AC015574.1-202ENST00000616588 456 ntTSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.014e-8■■■■■ 28.8
FMR1Q06787 HSP90B1-207ENST00000550595 694 ntTSL 28.51□□□□□ -1.054e-8■■■■■ 28.8
FMR1Q06787 AC015574.1-203ENST00000614344 498 ntTSL 58.36□□□□□ -1.074e-8■■■■■ 28.8
FMR1Q06787 TBC1D23-205ENST00000475134 2074 ntTSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.084e-8■■■■■ 28.8
FMR1Q06787 YLPM1-205ENST00000549293 5500 ntTSL 1 (best)7.59□□□□□ -1.194e-8■■■■■ 28.8
FMR1Q06787 AC015574.1-204ENST00000612595 512 ntTSL 57.26□□□□□ -1.254e-8■■■■■ 28.8
FMR1Q06787 RFWD2-202ENST00000367666 2022 ntTSL 27.13□□□□□ -1.274e-8■■■■■ 28.8
FMR1Q06787 AC015574.1-205ENST00000611285 524 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.274e-8■■■■■ 28.8
FMR1Q06787 TBC1D23-202ENST00000394144 3677 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.274e-8■■■■■ 28.8
FMR1Q06787 CLIC2-203ENST00000465553 902 ntTSL 36.81□□□□□ -1.321e-6■■■■■ 28.8
FMR1Q06787 IMMP1L-207ENST00000531331 437 ntTSL 36.61□□□□□ -1.354e-8■■■■■ 28.8
FMR1Q06787 CLIC2-201ENST00000321926 629 ntTSL 36.57□□□□□ -1.361e-6■■■■■ 28.8
FMR1Q06787 HIPK2-202ENST00000406875 15049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.384e-8■■■■■ 28.8
FMR1Q06787 TBC1D23-201ENST00000344949 3656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.464e-8■■■■■ 28.8
FMR1Q06787 CLIC2-204ENST00000491205 516 ntTSL 25.59□□□□□ -1.511e-6■■■■■ 28.8
FMR1Q06787 DNAH14-208ENST00000430092 13763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.522e-7■■■■■ 28.8
FMR1Q06787 CLIC2-202ENST00000369449 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.621e-6■■■■■ 28.8
FMR1Q06787 AFF1-207ENST00000511442 463 ntTSL 33.94□□□□□ -1.784e-8■■■■■ 28.8
FMR1Q06787 SACS-201ENST00000382292 15324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -24e-8■■■■■ 28.8
FMR1Q06787 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.132e-9■■■■■ 28.8
FMR1Q06787 FLNB-205ENST00000466455 404 ntTSL 321.4■■□□□ 1.023e-7■■■■■ 28.8
FMR1Q06787 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.071e-6■■■■■ 28.8
FMR1Q06787 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.11e-6■■■■■ 28.8
FMR1Q06787 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.151e-6■■■■■ 28.8
FMR1Q06787 WARS-244ENST00000627608 123 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.952e-20■■■■■ 28.7
FMR1Q06787 BCOR-210ENST00000442018 2189 ntTSL 212.6□□□□□ -0.392e-6■■■■■ 28.7
FMR1Q06787 BCOR-209ENST00000427012 1969 ntTSL 59.94□□□□□ -0.822e-6■■■■■ 28.7
FMR1Q06787 ANKRD11-203ENST00000378330 9132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.235e-7■■■■■ 28.7
FMR1Q06787 ANKRD11-201ENST00000301030 9301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.285e-7■■■■■ 28.7
FMR1Q06787 G3BP1-202ENST00000394123 10240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.452e-6■■■■■ 28.7
FMR1Q06787 DIAPH1-210ENST00000494967 629 ntTSL 217.11■□□□□ 0.332e-6■■■■■ 28.6
FMR1Q06787 DIAPH1-209ENST00000491754 557 ntTSL 414.67□□□□□ -0.062e-6■■■■■ 28.6
FMR1Q06787 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.238e-8■■■■■ 28.6
FMR1Q06787 RUNX1-216ENST00000482318 1710 ntTSL 1 (best)24.75■■□□□ 1.558e-8■■■■■ 28.6
FMR1Q06787 MACF1-215ENST00000473843 598 ntTSL 215.4■□□□□ 0.064e-6■■■■■ 28.6
FMR1Q06787 VARS-216ENST00000428445 863 ntTSL 521.81■■□□□ 1.084e-8■■■■■ 28.6
FMR1Q06787 SLC4A2-219ENST00000494298 496 ntTSL 422.55■■□□□ 1.24e-8■■■■■ 28.5
FMR1Q06787 CCT5-209ENST00000511700 582 ntTSL 314.59□□□□□ -0.071e-8■■■■■ 28.5
FMR1Q06787 CCT5-204ENST00000503454 762 ntTSL 39.6□□□□□ -0.871e-8■■■■■ 28.5
FMR1Q06787 CCT5-215ENST00000625723 135 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.171e-8■■■■■ 28.5
FMR1Q06787 CCT5-211ENST00000512975 578 ntTSL 47.64□□□□□ -1.191e-8■■■■■ 28.5
FMR1Q06787 AP000561.1-201ENST00000444130 435 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.432e-8■■■■■ 28.5
FMR1Q06787 COPB1-211ENST00000534234 1584 ntTSL 511.42□□□□□ -0.584e-7■■■■■ 28.5
FMR1Q06787 OGDH-203ENST00000439616 2962 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.092e-6■■■■■ 28.4
FMR1Q06787 OGDH-205ENST00000444676 3309 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.392e-6■■■■■ 28.4
FMR1Q06787 OGDH-207ENST00000449767 3479 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.572e-6■■■■■ 28.4
FMR1Q06787 OGDH-206ENST00000447398 3474 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.622e-6■■■■■ 28.4
FMR1Q06787 OGDH-201ENST00000222673 4181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.642e-6■■■■■ 28.4
FMR1Q06787 OGDH-210ENST00000631326 4116 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.872e-6■■■■■ 28.4
FMR1Q06787 DNMT1-226ENST00000592054 591 ntTSL 44.83□□□□□ -1.646e-7■■■■■ 28.4
FMR1Q06787 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.259e-8■■■■■ 28.4
FMR1Q06787 DYNC1H1-206ENST00000555204 353 ntTSL 310.19□□□□□ -0.783e-7■■■■■ 28.4
FMR1Q06787 RNF213-202ENST00000411702 6428 ntTSL 212.5□□□□□ -0.411e-6■■■■■ 28.4
FMR1Q06787 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.423e-6■■■■■ 28.4
FMR1Q06787 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.353e-6■■■■■ 28.4
FMR1Q06787 TUBGCP2-210ENST00000543663 4302 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.143e-6■■■■■ 28.4
FMR1Q06787 TUBGCP2-208ENST00000482278 3553 ntTSL 213.38□□□□□ -0.273e-6■■■■■ 28.4
FMR1Q06787 TUBGCP2-201ENST00000252936 3885 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.323e-6■■■■■ 28.4
FMR1Q06787 FLNB-209ENST00000477629 2058 ntTSL 215.21■□□□□ 0.032e-7■■■■■ 28.4
FMR1Q06787 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.032e-6■■■■■ 28.3
FMR1Q06787 MTCL1-209ENST00000520495 3286 ntTSL 217.65■□□□□ 0.422e-6■■■■■ 28.3
FMR1Q06787 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.422e-6■■■■■ 28.3
FMR1Q06787 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.362e-7■■■■■ 28.3
FMR1Q06787 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.282e-6■■■■■ 28.3
FMR1Q06787 MTCL1-202ENST00000359865 6093 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.032e-6■■■■■ 28.3
FMR1Q06787 TMEM201-203ENST00000416541 3447 ntTSL 1 (best)12.39□□□□□ -0.432e-7■■■■■ 28.3
FMR1Q06787 KIDINS220-209ENST00000489024 4084 ntTSL 59.23□□□□□ -0.938e-7■■■■■ 28.3
FMR1Q06787 KIDINS220-201ENST00000256707 7361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.028e-7■■■■■ 28.3
FMR1Q06787 KIDINS220-210ENST00000496383 3220 ntTSL 58.43□□□□□ -1.068e-7■■■■■ 28.3
FMR1Q06787 KIDINS220-206ENST00000473731 7248 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.178e-7■■■■■ 28.3
FMR1Q06787 KIDINS220-212ENST00000569008 8735 ntTSL 56.29□□□□□ -1.48e-7■■■■■ 28.3
FMR1Q06787 KIDINS220-208ENST00000488729 5988 ntTSL 1 (best)6.06□□□□□ -1.448e-7■■■■■ 28.3
FMR1Q06787 DDB1-215ENST00000539712 1020 ntTSL 221.39■■□□□ 1.011e-7■■■■■ 28.3
FMR1Q06787 FBXW11-207ENST00000519693 758 ntTSL 231.99■■■□□ 2.712e-7■■■■■ 28.3
FMR1Q06787 FBXW11-208ENST00000520376 686 ntTSL 230.22■■■□□ 2.432e-7■■■■■ 28.3
FMR1Q06787 FBXW11-204ENST00000517395 636 ntTSL 328.07■■■□□ 2.082e-7■■■■■ 28.3
FMR1Q06787 FBXW11-210ENST00000522507 306 ntTSL 325.62■■□□□ 1.692e-7■■■■■ 28.3
FMR1Q06787 FBXW11-212ENST00000523843 2099 ntTSL 524.53■■□□□ 1.522e-7■■■■■ 28.3
FMR1Q06787 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.472e-7■■■■■ 28.3
FMR1Q06787 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.232e-7■■■■■ 28.3
FMR1Q06787 CEP170-225ENST00000523581 582 ntTSL 221.99■■□□□ 1.112e-7■■■■■ 28.3
FMR1Q06787 WDR6-205ENST00000429900 563 ntTSL 521.66■■□□□ 1.062e-7■■■■■ 28.3
FMR1Q06787 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.822e-7■■■■■ 28.3
FMR1Q06787 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.792e-7■■■■■ 28.3
FMR1Q06787 SCP2-214ENST00000528809 570 ntTSL 520■□□□□ 0.792e-7■■■■■ 28.3
FMR1Q06787 CEP170-223ENST00000522995 608 ntTSL 319.61■□□□□ 0.732e-7■■■■■ 28.3
FMR1Q06787 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.72e-7■■■■■ 28.3
FMR1Q06787 COG2-204ENST00000473671 436 ntTSL 217.47■□□□□ 0.392e-7■■■■■ 28.3
FMR1Q06787 CEP170-221ENST00000522522 1180 ntTSL 1 (best)17.35■□□□□ 0.372e-7■■■■■ 28.3
FMR1Q06787 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.362e-7■■■■■ 28.3
Retrieved 100 of 13,491 protein–RNA pairs in 76.3 ms