Protein–RNA interactions for Protein: Q06702

CDA1, Chitin deacetylase 1, yeastyeast

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CDA1Q06702 SNO1YMR095C 675 nt5.76□□□□□ -1.49
CDA1Q06702 SFG1YOR315W 1041 nt5.76□□□□□ -1.49
CDA1Q06702 HXT3YDR345C 1704 nt5.76□□□□□ -1.49
CDA1Q06702 MTF2YDL044C 1323 nt5.75□□□□□ -1.49
CDA1Q06702 ATR1YML116W 1629 nt5.75□□□□□ -1.49
CDA1Q06702 PCS60YBR222C 1632 nt5.75□□□□□ -1.49
CDA1Q06702 BGL2YGR282C 942 nt5.75□□□□□ -1.49
CDA1Q06702 SPO11YHL022C 1197 nt5.75□□□□□ -1.49
CDA1Q06702 YLR124WYLR124W 345 nt5.75□□□□□ -1.49
CDA1Q06702 UIP3YAR027W 708 nt5.75□□□□□ -1.49
CDA1Q06702 NIT3YLR351C 876 nt5.75□□□□□ -1.49
CDA1Q06702 YPR027CYPR027C 834 nt5.75□□□□□ -1.49
CDA1Q06702 RPN7YPR108W 1290 nt5.75□□□□□ -1.49
CDA1Q06702 APM3YBR288C 1452 nt5.75□□□□□ -1.49
CDA1Q06702 IMA2YOL157C 1770 nt5.75□□□□□ -1.49
CDA1Q06702 URA7YBL039C 1740 nt5.74□□□□□ -1.49
CDA1Q06702 GSY2YLR258W 2118 nt5.74□□□□□ -1.49
CDA1Q06702 HSP104YLL026W 2727 nt5.74□□□□□ -1.49
CDA1Q06702 COX20YDR231C 618 nt5.74□□□□□ -1.49
CDA1Q06702 RNH202YDR279W 1053 nt5.74□□□□□ -1.49
CDA1Q06702 IPI1YHR085W 1005 nt5.74□□□□□ -1.49
CDA1Q06702 YIL077CYIL077C 963 nt5.74□□□□□ -1.49
CDA1Q06702 MAC1YMR021C 1254 nt5.74□□□□□ -1.49
CDA1Q06702 YNL042W-BYNL042W-B 258 nt5.74□□□□□ -1.49
CDA1Q06702 ECM18YDR125C 1362 nt5.74□□□□□ -1.49
CDA1Q06702 MRE11YMR224C 2079 nt5.74□□□□□ -1.49
CDA1Q06702 SKN1YGR143W 2316 nt5.74□□□□□ -1.49
CDA1Q06702 ATP1YBL099W 1638 nt5.74□□□□□ -1.49
CDA1Q06702 DON1YDR273W 1098 nt5.73□□□□□ -1.49
CDA1Q06702 YDR290WYDR290W 330 nt5.73□□□□□ -1.49
CDA1Q06702 PEX14YGL153W 1026 nt5.73□□□□□ -1.49
CDA1Q06702 DSD1YGL196W 1287 nt5.73□□□□□ -1.49
CDA1Q06702 SUP19tS(UGA)E 82 nt5.73□□□□□ -1.49
CDA1Q06702 SUP17tS(UGA)I 82 nt5.73□□□□□ -1.49
CDA1Q06702 SUP16tS(UGA)P 82 nt5.73□□□□□ -1.49
CDA1Q06702 RPS5YJR123W 678 nt5.73□□□□□ -1.49
CDA1Q06702 YML131WYML131W 1098 nt5.73□□□□□ -1.49
CDA1Q06702 YMR245WYMR245W 621 nt5.73□□□□□ -1.49
CDA1Q06702 SHP1YBL058W 1272 nt5.73□□□□□ -1.49
CDA1Q06702 NCE102YPR149W 522 nt5.73□□□□□ -1.49
CDA1Q06702 SEC18YBR080C 2277 nt5.73□□□□□ -1.49
CDA1Q06702 SUB2YDL084W 1341 nt5.73□□□□□ -1.49
CDA1Q06702 YEL020CYEL020C 1683 nt5.72□□□□□ -1.49
CDA1Q06702 TBF1YPL128C 1689 nt5.72□□□□□ -1.49
CDA1Q06702 IML2YJL082W 2196 nt5.72□□□□□ -1.49
CDA1Q06702 ESC2YDR363W 1371 nt5.72□□□□□ -1.49
CDA1Q06702 SEC20YDR498C 1152 nt5.72□□□□□ -1.49
CDA1Q06702 YHB1YGR234W 1200 nt5.72□□□□□ -1.49
CDA1Q06702 RPC17YJL011C 486 nt5.72□□□□□ -1.49
CDA1Q06702 YKL223WYKL223W 333 nt5.72□□□□□ -1.49
CDA1Q06702 SMD3YLR147C 306 nt5.72□□□□□ -1.49
CDA1Q06702 YLR363W-AYLR363W-A 258 nt5.72□□□□□ -1.49
CDA1Q06702 CIN4YMR138W 576 nt5.72□□□□□ -1.49
CDA1Q06702 IBD2YNL164C 1056 nt5.72□□□□□ -1.49
CDA1Q06702 YPL073CYPL073C 486 nt5.72□□□□□ -1.49
CDA1Q06702 SET6YPL165C 1122 nt5.72□□□□□ -1.49
CDA1Q06702 YPR015CYPR015C 744 nt5.72□□□□□ -1.49
CDA1Q06702 APE3YBR286W 1614 nt5.72□□□□□ -1.49
CDA1Q06702 RSC30YHR056C 2652 nt5.72□□□□□ -1.49
CDA1Q06702 RET1YOR207C 3450 nt5.72□□□□□ -1.49
CDA1Q06702 AIM10YER087W 1731 nt5.71□□□□□ -1.49
CDA1Q06702 YDL057WYDL057W 987 nt5.71□□□□□ -1.5
CDA1Q06702 YDR220CYDR220C 294 nt5.71□□□□□ -1.5
CDA1Q06702 DOT5YIL010W 648 nt5.71□□□□□ -1.5
CDA1Q06702 NPA3YJR072C 1158 nt5.71□□□□□ -1.5
CDA1Q06702 MTC2YKL098W 1074 nt5.71□□□□□ -1.5
CDA1Q06702 STM1YLR150W 822 nt5.71□□□□□ -1.5
CDA1Q06702 RUF20RUF20 443 nt5.71□□□□□ -1.5
CDA1Q06702 POR1YNL055C 852 nt5.71□□□□□ -1.5
CDA1Q06702 POC4YPL144W 447 nt5.71□□□□□ -1.5
CDA1Q06702 RPO26YPR187W 468 nt5.71□□□□□ -1.5
CDA1Q06702 SAD1YFR005C 1347 nt5.71□□□□□ -1.5
CDA1Q06702 STL1YDR536W 1710 nt5.71□□□□□ -1.5
CDA1Q06702 YDR109CYDR109C 2148 nt5.71□□□□□ -1.5
CDA1Q06702 RIM101YHL027W 1878 nt5.71□□□□□ -1.5
CDA1Q06702 SSU1YPL092W 1377 nt5.7□□□□□ -1.5
CDA1Q06702 BUD32YGR262C 786 nt5.7□□□□□ -1.5
CDA1Q06702 YJL032WYJL032W 315 nt5.7□□□□□ -1.5
CDA1Q06702 SPC3YLR066W 555 nt5.7□□□□□ -1.5
CDA1Q06702 YML101C-AYML101C-A 318 nt5.7□□□□□ -1.5
CDA1Q06702 ELA1YNL230C 1140 nt5.7□□□□□ -1.5
CDA1Q06702 YNR025CYNR025C 360 nt5.7□□□□□ -1.5
CDA1Q06702 YOR008W-BYOR008W-B 102 nt5.7□□□□□ -1.5
CDA1Q06702 CSH1YBR161W 1131 nt5.7□□□□□ -1.5
CDA1Q06702 YCL041CYCL041C 495 nt5.7□□□□□ -1.5
CDA1Q06702 LDB19YOR322C 2457 nt5.7□□□□□ -1.5
CDA1Q06702 DEG1YFL001W 1329 nt5.7□□□□□ -1.5
CDA1Q06702 HSF1YGL073W 2502 nt5.7□□□□□ -1.5
CDA1Q06702 LCB2YDR062W 1686 nt5.69□□□□□ -1.5
CDA1Q06702 BMH1YER177W 804 nt5.69□□□□□ -1.5
CDA1Q06702 DCV1YFR012W 609 nt5.69□□□□□ -1.5
CDA1Q06702 RPC25YKL144C 639 nt5.69□□□□□ -1.5
CDA1Q06702 NTR2YKR022C 969 nt5.69□□□□□ -1.5
CDA1Q06702 YLR156WYLR156W 345 nt5.69□□□□□ -1.5
CDA1Q06702 YLR157W-DYLR157W-D 213 nt5.69□□□□□ -1.5
CDA1Q06702 YLR159WYLR159W 345 nt5.69□□□□□ -1.5
CDA1Q06702 YLR161WYLR161W 345 nt5.69□□□□□ -1.5
CDA1Q06702 EMG1YLR186W 759 nt5.69□□□□□ -1.5
CDA1Q06702 HEK2YBL032W 1146 nt5.69□□□□□ -1.5
CDA1Q06702 PFA3YNL326C 1011 nt5.69□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 46.4 ms