Protein–RNA interactions for Protein: Q06106

MRD1, Multiple RNA-binding domain-containing protein 1, yeast

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MRD1	Q06106	BRE2	YLR015W	1518 nt		5.58	□□□□□ -1.52
MRD1	Q06106	YDL121C	YDL121C	450 nt		5.58	□□□□□ -1.52
MRD1	Q06106	SRG1	SRG1	551 nt		5.58	□□□□□ -1.52
MRD1	Q06106	PPG1	YNR032W	1107 nt		5.58	□□□□□ -1.52
MRD1	Q06106	PRM1	YNL279W	1986 nt		5.58	□□□□□ -1.52
MRD1	Q06106	SLT2	YHR030C	1455 nt		5.58	□□□□□ -1.52
MRD1	Q06106	HRR25	YPL204W	1485 nt		5.58	□□□□□ -1.52
MRD1	Q06106	MMT2	YPL224C	1455 nt		5.58	□□□□□ -1.52
MRD1	Q06106	WTM2	YOR229W	1404 nt		5.57	□□□□□ -1.52
MRD1	Q06106	STE20	YHL007C	2820 nt		5.57	□□□□□ -1.52
MRD1	Q06106	PMA1	YGL008C	2757 nt		5.57	□□□□□ -1.52
MRD1	Q06106	NUP1	YOR098C	3231 nt		5.57	□□□□□ -1.52
MRD1	Q06106	MDG1	YNL173C	1101 nt		5.57	□□□□□ -1.52
MRD1	Q06106	YIF1	YNL263C	945 nt		5.57	□□□□□ -1.52
MRD1	Q06106	HMT1	YBR034C	1047 nt		5.57	□□□□□ -1.52
MRD1	Q06106	REG2	YBR050C	1017 nt		5.57	□□□□□ -1.52
MRD1	Q06106	COX11	YPL132W	903 nt		5.57	□□□□□ -1.52
MRD1	Q06106	FRE3	YOR381W	2136 nt		5.57	□□□□□ -1.52
MRD1	Q06106	AIM10	YER087W	1731 nt		5.57	□□□□□ -1.52
MRD1	Q06106	YJR124C	YJR124C	1347 nt		5.56	□□□□□ -1.52
MRD1	Q06106	YHR182W	YHR182W	2358 nt		5.56	□□□□□ -1.52
MRD1	Q06106	PDE1	YGL248W	1110 nt		5.56	□□□□□ -1.52
MRD1	Q06106	YIR043C	YIR043C	693 nt		5.56	□□□□□ -1.52
MRD1	Q06106	NPT1	YOR209C	1290 nt		5.56	□□□□□ -1.52
MRD1	Q06106	YPR150W	YPR150W	522 nt		5.56	□□□□□ -1.52
MRD1	Q06106	GPI18	YBR004C	1302 nt		5.55	□□□□□ -1.52
MRD1	Q06106	ASA1	YPR085C	1332 nt		5.55	□□□□□ -1.52
MRD1	Q06106	ATH1	YPR026W	3636 nt		5.55	□□□□□ -1.52
MRD1	Q06106	YDL027C	YDL027C	1263 nt		5.55	□□□□□ -1.52
MRD1	Q06106	MRS3	YJL133W	945 nt		5.55	□□□□□ -1.52
MRD1	Q06106	YKL107W	YKL107W	930 nt		5.55	□□□□□ -1.52
MRD1	Q06106	MTF1	YMR228W	1026 nt		5.55	□□□□□ -1.52
MRD1	Q06106	RCL1	YOL010W	1104 nt		5.55	□□□□□ -1.52
MRD1	Q06106	ZPS1	YOL154W	750 nt		5.55	□□□□□ -1.52
MRD1	Q06106	COA2	YPL189C-A	207 nt		5.55	□□□□□ -1.52
MRD1	Q06106	NHP6A	YPR052C	282 nt		5.55	□□□□□ -1.52
MRD1	Q06106	AFT1	YGL071W	2073 nt		5.55	□□□□□ -1.52
MRD1	Q06106	ATM1	YMR301C	2073 nt		5.55	□□□□□ -1.52
MRD1	Q06106	YBR138C	YBR138C	1575 nt		5.55	□□□□□ -1.52
MRD1	Q06106	TRS23	YDR246W	660 nt		5.54	□□□□□ -1.52
MRD1	Q06106	ECT1	YGR007W	972 nt		5.54	□□□□□ -1.52
MRD1	Q06106	CAX4	YGR036C	720 nt		5.54	□□□□□ -1.52
MRD1	Q06106	YHR095W	YHR095W	495 nt		5.54	□□□□□ -1.52
MRD1	Q06106	MET31	YPL038W	534 nt		5.54	□□□□□ -1.52
MRD1	Q06106	MMR1	YLR190W	1476 nt		5.53	□□□□□ -1.52
MRD1	Q06106	RAM1	YDL090C	1296 nt		5.53	□□□□□ -1.52
MRD1	Q06106	YIL171W-A	YIL171W-A	453 nt		5.53	□□□□□ -1.52
MRD1	Q06106	YJL220W	YJL220W	453 nt		5.53	□□□□□ -1.52
MRD1	Q06106	YML057C-A	YML057C-A	390 nt		5.53	□□□□□ -1.52
MRD1	Q06106	MRPL24	YMR193W	777 nt		5.53	□□□□□ -1.52
MRD1	Q06106	DCI1	YOR180C	816 nt		5.53	□□□□□ -1.52
MRD1	Q06106	ALG5	YPL227C	1005 nt		5.53	□□□□□ -1.52
MRD1	Q06106	PUT1	YLR142W	1431 nt		5.53	□□□□□ -1.52
MRD1	Q06106	NUP116	YMR047C	3342 nt		5.53	□□□□□ -1.52
MRD1	Q06106	YMR102C	YMR102C	2505 nt		5.53	□□□□□ -1.52
MRD1	Q06106	ASK10	YGR097W	3441 nt		5.53	□□□□□ -1.52
MRD1	Q06106	TOS3	YGL179C	1683 nt		5.53	□□□□□ -1.52
MRD1	Q06106	WHI4	YDL224C	1950 nt		5.53	□□□□□ -1.52
MRD1	Q06106	SNF3	YDL194W	2655 nt		5.52	□□□□□ -1.53
MRD1	Q06106	KCH1	YJR054W	1494 nt		5.52	□□□□□ -1.53
MRD1	Q06106	CAB1	YDR531W	1104 nt		5.52	□□□□□ -1.53
MRD1	Q06106	SCS2	YER120W	735 nt		5.52	□□□□□ -1.53
MRD1	Q06106	YPL191C	YPL191C	1083 nt		5.52	□□□□□ -1.53
MRD1	Q06106	TIP41	YPR040W	1071 nt		5.52	□□□□□ -1.53
MRD1	Q06106	APM2	YHL019C	1818 nt		5.52	□□□□□ -1.53
MRD1	Q06106	NOC4	YPR144C	1659 nt		5.51	□□□□□ -1.53
MRD1	Q06106	TRX2	YGR209C	315 nt		5.51	□□□□□ -1.53
MRD1	Q06106	YLF2	YHL014C	1218 nt		5.51	□□□□□ -1.53
MRD1	Q06106	YMR245W	YMR245W	621 nt		5.51	□□□□□ -1.53
MRD1	Q06106	HXT14	YNL318C	1623 nt		5.51	□□□□□ -1.53
MRD1	Q06106	LPL1	YOR059C	1353 nt		5.51	□□□□□ -1.53
MRD1	Q06106	GRS1	YBR121C	2004 nt		5.5	□□□□□ -1.53
MRD1	Q06106	AAD4	YDL243C	990 nt		5.5	□□□□□ -1.53
MRD1	Q06106	RRP1	YDR087C	837 nt		5.5	□□□□□ -1.53
MRD1	Q06106	YER084W	YER084W	387 nt		5.5	□□□□□ -1.53
MRD1	Q06106	SKG1	YKR100C	1068 nt		5.5	□□□□□ -1.53
MRD1	Q06106	PML1	YLR016C	615 nt		5.5	□□□□□ -1.53
MRD1	Q06106	RPP0	YLR340W	939 nt		5.5	□□□□□ -1.53
MRD1	Q06106	BUB3	YOR026W	1026 nt		5.5	□□□□□ -1.53
MRD1	Q06106	UBA3	YPR066W	900 nt		5.5	□□□□□ -1.53
MRD1	Q06106	MGS1	YNL218W	1764 nt		5.5	□□□□□ -1.53
MRD1	Q06106	WTM1	YOR230W	1314 nt		5.49	□□□□□ -1.53
MRD1	Q06106	SLC1	YDL052C	912 nt		5.49	□□□□□ -1.53
MRD1	Q06106	HSP31	YDR533C	714 nt		5.49	□□□□□ -1.53
MRD1	Q06106	YFR035C	YFR035C	345 nt		5.49	□□□□□ -1.53
MRD1	Q06106	YOL079W	YOL079W	399 nt		5.49	□□□□□ -1.53
MRD1	Q06106	BUD7	YOR299W	2241 nt		5.49	□□□□□ -1.53
MRD1	Q06106	SED4	YCR067C	3198 nt		5.49	□□□□□ -1.53
MRD1	Q06106	SEC9	YGR009C	1956 nt		5.49	□□□□□ -1.53
MRD1	Q06106	TDA6	YPR157W	1404 nt		5.48	□□□□□ -1.53
MRD1	Q06106	DBF2	YGR092W	1719 nt		5.48	□□□□□ -1.53
MRD1	Q06106	ARH1	YDR376W	1482 nt		5.48	□□□□□ -1.53
MRD1	Q06106	YPL245W	YPL245W	1365 nt		5.48	□□□□□ -1.53
MRD1	Q06106	YCR006C	YCR006C	474 nt		5.48	□□□□□ -1.53
MRD1	Q06106	AIR2	YDL175C	1035 nt		5.48	□□□□□ -1.53
MRD1	Q06106	SRN2	YLR119W	642 nt		5.48	□□□□□ -1.53
MRD1	Q06106	APS1	YLR170C	471 nt		5.48	□□□□□ -1.53
MRD1	Q06106	AIF1	YNR074C	1137 nt		5.48	□□□□□ -1.53
MRD1	Q06106	TLG2	YOL018C	1194 nt		5.48	□□□□□ -1.53
MRD1	Q06106	OAZ1	YPL052W	879 nt		5.48	□□□□□ -1.53

Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 14.5 ms