Protein–RNA interactions for Protein: Q05519

SRSF11, Serine/arginine-rich splicing factor 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF11Q05519 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SRSF11Q05519 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SRSF11Q05519 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SRSF11Q05519 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SRSF11Q05519 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SRSF11Q05519 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SRSF11Q05519 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SRSF11Q05519 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SRSF11Q05519 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SRSF11Q05519 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SRSF11Q05519 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SRSF11Q05519 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SRSF11Q05519 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SRSF11Q05519 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SRSF11Q05519 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SRSF11Q05519 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SRSF11Q05519 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SRSF11Q05519 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SRSF11Q05519 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SRSF11Q05519 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SRSF11Q05519 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SRSF11Q05519 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SRSF11Q05519 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SRSF11Q05519 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SRSF11Q05519 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SRSF11Q05519 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SRSF11Q05519 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SRSF11Q05519 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SRSF11Q05519 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SRSF11Q05519 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SRSF11Q05519 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SRSF11Q05519 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SRSF11Q05519 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SRSF11Q05519 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SRSF11Q05519 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SRSF11Q05519 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SRSF11Q05519 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SRSF11Q05519 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SRSF11Q05519 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SRSF11Q05519 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SRSF11Q05519 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SRSF11Q05519 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SRSF11Q05519 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SRSF11Q05519 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SRSF11Q05519 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SRSF11Q05519 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SRSF11Q05519 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SRSF11Q05519 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SRSF11Q05519 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SRSF11Q05519 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SRSF11Q05519 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SRSF11Q05519 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SRSF11Q05519 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SRSF11Q05519 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SRSF11Q05519 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SRSF11Q05519 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SRSF11Q05519 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SRSF11Q05519 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SRSF11Q05519 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SRSF11Q05519 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SRSF11Q05519 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SRSF11Q05519 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SRSF11Q05519 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SRSF11Q05519 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SRSF11Q05519 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SRSF11Q05519 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SRSF11Q05519 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SRSF11Q05519 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SRSF11Q05519 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SRSF11Q05519 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SRSF11Q05519 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SRSF11Q05519 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SRSF11Q05519 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SRSF11Q05519 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SRSF11Q05519 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SRSF11Q05519 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SRSF11Q05519 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SRSF11Q05519 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SRSF11Q05519 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SRSF11Q05519 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SRSF11Q05519 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SRSF11Q05519 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SRSF11Q05519 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SRSF11Q05519 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SRSF11Q05519 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SRSF11Q05519 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SRSF11Q05519 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SRSF11Q05519 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SRSF11Q05519 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SRSF11Q05519 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SRSF11Q05519 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SRSF11Q05519 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SRSF11Q05519 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SRSF11Q05519 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SRSF11Q05519 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SRSF11Q05519 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SRSF11Q05519 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SRSF11Q05519 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SRSF11Q05519 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SRSF11Q05519 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms