Protein–RNA interactions for Protein: Q05066

SRY, Sex-determining region Y protein, humanhuman

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRYQ05066 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SRYQ05066 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SRYQ05066 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SRYQ05066 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SRYQ05066 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SRYQ05066 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SRYQ05066 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SRYQ05066 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SRYQ05066 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SRYQ05066 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SRYQ05066 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SRYQ05066 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SRYQ05066 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SRYQ05066 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SRYQ05066 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SRYQ05066 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SRYQ05066 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SRYQ05066 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SRYQ05066 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SRYQ05066 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SRYQ05066 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SRYQ05066 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SRYQ05066 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SRYQ05066 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SRYQ05066 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SRYQ05066 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SRYQ05066 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SRYQ05066 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SRYQ05066 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SRYQ05066 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SRYQ05066 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SRYQ05066 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SRYQ05066 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SRYQ05066 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SRYQ05066 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SRYQ05066 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SRYQ05066 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SRYQ05066 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SRYQ05066 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SRYQ05066 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SRYQ05066 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SRYQ05066 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SRYQ05066 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SRYQ05066 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SRYQ05066 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SRYQ05066 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SRYQ05066 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SRYQ05066 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SRYQ05066 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SRYQ05066 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SRYQ05066 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SRYQ05066 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SRYQ05066 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SRYQ05066 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SRYQ05066 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SRYQ05066 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SRYQ05066 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SRYQ05066 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SRYQ05066 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SRYQ05066 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SRYQ05066 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SRYQ05066 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SRYQ05066 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SRYQ05066 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SRYQ05066 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
SRYQ05066 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SRYQ05066 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SRYQ05066 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SRYQ05066 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SRYQ05066 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SRYQ05066 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SRYQ05066 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SRYQ05066 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SRYQ05066 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SRYQ05066 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SRYQ05066 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SRYQ05066 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
SRYQ05066 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SRYQ05066 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SRYQ05066 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SRYQ05066 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SRYQ05066 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SRYQ05066 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SRYQ05066 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SRYQ05066 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SRYQ05066 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SRYQ05066 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SRYQ05066 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SRYQ05066 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SRYQ05066 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SRYQ05066 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
SRYQ05066 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SRYQ05066 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SRYQ05066 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SRYQ05066 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SRYQ05066 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SRYQ05066 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SRYQ05066 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SRYQ05066 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SRYQ05066 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms