Protein–RNA interactions for Protein: Q04656

ATP7A, Copper-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7AQ04656 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
ATP7AQ04656 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
ATP7AQ04656 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
ATP7AQ04656 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
ATP7AQ04656 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
ATP7AQ04656 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
ATP7AQ04656 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
ATP7AQ04656 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC34.55■■■■□ 3.12
ATP7AQ04656 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
ATP7AQ04656 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC34.54■■■■□ 3.12
ATP7AQ04656 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
ATP7AQ04656 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC34.54■■■■□ 3.12
ATP7AQ04656 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
ATP7AQ04656 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC34.54■■■■□ 3.12
ATP7AQ04656 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
ATP7AQ04656 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
ATP7AQ04656 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
ATP7AQ04656 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
ATP7AQ04656 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
ATP7AQ04656 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
ATP7AQ04656 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
ATP7AQ04656 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
ATP7AQ04656 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC34.53■■■■□ 3.12
ATP7AQ04656 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
ATP7AQ04656 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
ATP7AQ04656 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC34.52■■■■□ 3.12
ATP7AQ04656 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC34.52■■■■□ 3.12
ATP7AQ04656 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
ATP7AQ04656 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
ATP7AQ04656 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
ATP7AQ04656 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
ATP7AQ04656 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
ATP7AQ04656 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
ATP7AQ04656 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
ATP7AQ04656 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.51■■■■□ 3.11
ATP7AQ04656 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
ATP7AQ04656 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC34.5■■■■□ 3.11
ATP7AQ04656 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC34.5■■■■□ 3.11
ATP7AQ04656 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC34.5■■■■□ 3.11
ATP7AQ04656 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
ATP7AQ04656 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC34.5■■■■□ 3.11
ATP7AQ04656 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
ATP7AQ04656 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
ATP7AQ04656 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
ATP7AQ04656 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
ATP7AQ04656 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
ATP7AQ04656 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
ATP7AQ04656 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
ATP7AQ04656 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
ATP7AQ04656 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
ATP7AQ04656 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
ATP7AQ04656 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
ATP7AQ04656 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
ATP7AQ04656 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
ATP7AQ04656 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
ATP7AQ04656 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
ATP7AQ04656 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC34.46■■■■□ 3.11
ATP7AQ04656 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC34.46■■■■□ 3.11
ATP7AQ04656 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC34.46■■■■□ 3.11
ATP7AQ04656 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
ATP7AQ04656 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.46■■■■□ 3.11
ATP7AQ04656 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
ATP7AQ04656 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
ATP7AQ04656 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC34.45■■■■□ 3.11
ATP7AQ04656 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
ATP7AQ04656 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
ATP7AQ04656 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.1
ATP7AQ04656 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC34.45■■■■□ 3.1
ATP7AQ04656 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
ATP7AQ04656 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
ATP7AQ04656 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
ATP7AQ04656 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
ATP7AQ04656 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
ATP7AQ04656 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC34.44■■■■□ 3.1
ATP7AQ04656 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
ATP7AQ04656 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
ATP7AQ04656 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC34.44■■■■□ 3.1
ATP7AQ04656 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
ATP7AQ04656 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC34.43■■■■□ 3.1
ATP7AQ04656 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
ATP7AQ04656 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC34.43■■■■□ 3.1
ATP7AQ04656 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
ATP7AQ04656 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
ATP7AQ04656 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
ATP7AQ04656 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
ATP7AQ04656 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
ATP7AQ04656 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
ATP7AQ04656 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
ATP7AQ04656 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC34.42■■■■□ 3.1
ATP7AQ04656 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
ATP7AQ04656 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC34.42■■■■□ 3.1
ATP7AQ04656 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC34.42■■■■□ 3.1
ATP7AQ04656 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC34.42■■■■□ 3.1
ATP7AQ04656 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC34.42■■■■□ 3.1
ATP7AQ04656 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC34.42■■■■□ 3.1
ATP7AQ04656 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC34.42■■■■□ 3.1
ATP7AQ04656 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC34.42■■■■□ 3.1
ATP7AQ04656 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC34.41■■■■□ 3.1
ATP7AQ04656 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC34.41■■■■□ 3.1
ATP7AQ04656 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 136.4 ms