Protein–RNA interactions for Protein: Q02556

IRF8, Interferon regulatory factor 8, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF8Q02556 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IRF8Q02556 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IRF8Q02556 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IRF8Q02556 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IRF8Q02556 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IRF8Q02556 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IRF8Q02556 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IRF8Q02556 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IRF8Q02556 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IRF8Q02556 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IRF8Q02556 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IRF8Q02556 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IRF8Q02556 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IRF8Q02556 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IRF8Q02556 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IRF8Q02556 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IRF8Q02556 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IRF8Q02556 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IRF8Q02556 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IRF8Q02556 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IRF8Q02556 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IRF8Q02556 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
IRF8Q02556 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IRF8Q02556 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IRF8Q02556 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IRF8Q02556 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IRF8Q02556 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IRF8Q02556 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IRF8Q02556 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IRF8Q02556 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IRF8Q02556 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IRF8Q02556 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IRF8Q02556 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IRF8Q02556 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IRF8Q02556 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IRF8Q02556 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IRF8Q02556 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IRF8Q02556 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IRF8Q02556 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IRF8Q02556 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IRF8Q02556 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IRF8Q02556 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IRF8Q02556 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IRF8Q02556 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IRF8Q02556 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IRF8Q02556 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IRF8Q02556 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
IRF8Q02556 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
IRF8Q02556 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
IRF8Q02556 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
IRF8Q02556 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
IRF8Q02556 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IRF8Q02556 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IRF8Q02556 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IRF8Q02556 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IRF8Q02556 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IRF8Q02556 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IRF8Q02556 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IRF8Q02556 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IRF8Q02556 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IRF8Q02556 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IRF8Q02556 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IRF8Q02556 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IRF8Q02556 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IRF8Q02556 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IRF8Q02556 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IRF8Q02556 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IRF8Q02556 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IRF8Q02556 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IRF8Q02556 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
IRF8Q02556 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IRF8Q02556 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IRF8Q02556 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IRF8Q02556 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IRF8Q02556 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IRF8Q02556 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IRF8Q02556 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IRF8Q02556 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IRF8Q02556 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IRF8Q02556 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IRF8Q02556 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IRF8Q02556 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IRF8Q02556 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IRF8Q02556 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IRF8Q02556 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IRF8Q02556 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
IRF8Q02556 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IRF8Q02556 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IRF8Q02556 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IRF8Q02556 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IRF8Q02556 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IRF8Q02556 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IRF8Q02556 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IRF8Q02556 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IRF8Q02556 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IRF8Q02556 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IRF8Q02556 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
IRF8Q02556 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IRF8Q02556 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
IRF8Q02556 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms