Protein–RNA interactions for Protein: Q02548

PAX5, Paired box protein Pax-5, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX5Q02548 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PAX5Q02548 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PAX5Q02548 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PAX5Q02548 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PAX5Q02548 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PAX5Q02548 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PAX5Q02548 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PAX5Q02548 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PAX5Q02548 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PAX5Q02548 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PAX5Q02548 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PAX5Q02548 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PAX5Q02548 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PAX5Q02548 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PAX5Q02548 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PAX5Q02548 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PAX5Q02548 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PAX5Q02548 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PAX5Q02548 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PAX5Q02548 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PAX5Q02548 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PAX5Q02548 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PAX5Q02548 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PAX5Q02548 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PAX5Q02548 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PAX5Q02548 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PAX5Q02548 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PAX5Q02548 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PAX5Q02548 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PAX5Q02548 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PAX5Q02548 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PAX5Q02548 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PAX5Q02548 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PAX5Q02548 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PAX5Q02548 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PAX5Q02548 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PAX5Q02548 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PAX5Q02548 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PAX5Q02548 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PAX5Q02548 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PAX5Q02548 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PAX5Q02548 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PAX5Q02548 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PAX5Q02548 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PAX5Q02548 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PAX5Q02548 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PAX5Q02548 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PAX5Q02548 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PAX5Q02548 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PAX5Q02548 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PAX5Q02548 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PAX5Q02548 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PAX5Q02548 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PAX5Q02548 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PAX5Q02548 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PAX5Q02548 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PAX5Q02548 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PAX5Q02548 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PAX5Q02548 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PAX5Q02548 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PAX5Q02548 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PAX5Q02548 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PAX5Q02548 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PAX5Q02548 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PAX5Q02548 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PAX5Q02548 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PAX5Q02548 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PAX5Q02548 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PAX5Q02548 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PAX5Q02548 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PAX5Q02548 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PAX5Q02548 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PAX5Q02548 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PAX5Q02548 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PAX5Q02548 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PAX5Q02548 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
PAX5Q02548 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PAX5Q02548 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PAX5Q02548 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PAX5Q02548 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PAX5Q02548 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PAX5Q02548 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PAX5Q02548 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PAX5Q02548 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PAX5Q02548 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
PAX5Q02548 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PAX5Q02548 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PAX5Q02548 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PAX5Q02548 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PAX5Q02548 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PAX5Q02548 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PAX5Q02548 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PAX5Q02548 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PAX5Q02548 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PAX5Q02548 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PAX5Q02548 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PAX5Q02548 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PAX5Q02548 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PAX5Q02548 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PAX5Q02548 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms