Protein–RNA interactions for Protein: Q02338

BDH1, D-beta-hydroxybutyrate dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BDH1Q02338 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BDH1Q02338 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
BDH1Q02338 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
BDH1Q02338 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
BDH1Q02338 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
BDH1Q02338 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BDH1Q02338 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BDH1Q02338 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
BDH1Q02338 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BDH1Q02338 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
BDH1Q02338 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
BDH1Q02338 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
BDH1Q02338 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BDH1Q02338 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BDH1Q02338 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BDH1Q02338 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BDH1Q02338 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
BDH1Q02338 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BDH1Q02338 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BDH1Q02338 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BDH1Q02338 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
BDH1Q02338 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BDH1Q02338 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BDH1Q02338 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BDH1Q02338 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BDH1Q02338 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BDH1Q02338 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BDH1Q02338 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BDH1Q02338 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BDH1Q02338 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BDH1Q02338 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BDH1Q02338 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BDH1Q02338 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BDH1Q02338 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BDH1Q02338 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BDH1Q02338 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BDH1Q02338 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BDH1Q02338 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BDH1Q02338 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BDH1Q02338 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BDH1Q02338 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BDH1Q02338 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
BDH1Q02338 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BDH1Q02338 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BDH1Q02338 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BDH1Q02338 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BDH1Q02338 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BDH1Q02338 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BDH1Q02338 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BDH1Q02338 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BDH1Q02338 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BDH1Q02338 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BDH1Q02338 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BDH1Q02338 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BDH1Q02338 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BDH1Q02338 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BDH1Q02338 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
BDH1Q02338 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
BDH1Q02338 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BDH1Q02338 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BDH1Q02338 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BDH1Q02338 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
BDH1Q02338 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BDH1Q02338 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
BDH1Q02338 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BDH1Q02338 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BDH1Q02338 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BDH1Q02338 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BDH1Q02338 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BDH1Q02338 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BDH1Q02338 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BDH1Q02338 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BDH1Q02338 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BDH1Q02338 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BDH1Q02338 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BDH1Q02338 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BDH1Q02338 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BDH1Q02338 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BDH1Q02338 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BDH1Q02338 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BDH1Q02338 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BDH1Q02338 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BDH1Q02338 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BDH1Q02338 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BDH1Q02338 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BDH1Q02338 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BDH1Q02338 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BDH1Q02338 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BDH1Q02338 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BDH1Q02338 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BDH1Q02338 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BDH1Q02338 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BDH1Q02338 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BDH1Q02338 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BDH1Q02338 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BDH1Q02338 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BDH1Q02338 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BDH1Q02338 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BDH1Q02338 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BDH1Q02338 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms