Protein–RNA interactions for Protein: Q02318

CYP27A1, Sterol 26-hydroxylase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP27A1Q02318 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CYP27A1Q02318 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CYP27A1Q02318 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CYP27A1Q02318 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CYP27A1Q02318 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CYP27A1Q02318 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CYP27A1Q02318 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CYP27A1Q02318 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CYP27A1Q02318 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CYP27A1Q02318 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CYP27A1Q02318 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CYP27A1Q02318 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CYP27A1Q02318 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CYP27A1Q02318 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CYP27A1Q02318 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CYP27A1Q02318 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CYP27A1Q02318 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CYP27A1Q02318 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CYP27A1Q02318 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CYP27A1Q02318 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CYP27A1Q02318 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CYP27A1Q02318 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CYP27A1Q02318 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CYP27A1Q02318 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CYP27A1Q02318 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CYP27A1Q02318 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CYP27A1Q02318 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CYP27A1Q02318 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CYP27A1Q02318 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CYP27A1Q02318 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CYP27A1Q02318 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CYP27A1Q02318 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CYP27A1Q02318 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CYP27A1Q02318 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CYP27A1Q02318 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CYP27A1Q02318 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CYP27A1Q02318 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CYP27A1Q02318 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CYP27A1Q02318 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CYP27A1Q02318 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CYP27A1Q02318 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CYP27A1Q02318 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CYP27A1Q02318 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CYP27A1Q02318 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CYP27A1Q02318 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CYP27A1Q02318 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CYP27A1Q02318 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CYP27A1Q02318 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CYP27A1Q02318 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CYP27A1Q02318 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CYP27A1Q02318 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CYP27A1Q02318 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CYP27A1Q02318 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CYP27A1Q02318 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CYP27A1Q02318 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CYP27A1Q02318 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CYP27A1Q02318 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CYP27A1Q02318 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CYP27A1Q02318 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CYP27A1Q02318 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CYP27A1Q02318 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CYP27A1Q02318 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CYP27A1Q02318 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CYP27A1Q02318 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CYP27A1Q02318 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CYP27A1Q02318 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CYP27A1Q02318 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CYP27A1Q02318 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CYP27A1Q02318 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CYP27A1Q02318 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CYP27A1Q02318 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CYP27A1Q02318 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CYP27A1Q02318 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CYP27A1Q02318 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CYP27A1Q02318 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CYP27A1Q02318 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CYP27A1Q02318 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CYP27A1Q02318 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CYP27A1Q02318 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CYP27A1Q02318 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CYP27A1Q02318 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CYP27A1Q02318 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CYP27A1Q02318 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CYP27A1Q02318 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CYP27A1Q02318 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CYP27A1Q02318 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CYP27A1Q02318 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CYP27A1Q02318 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CYP27A1Q02318 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CYP27A1Q02318 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CYP27A1Q02318 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CYP27A1Q02318 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CYP27A1Q02318 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CYP27A1Q02318 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CYP27A1Q02318 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CYP27A1Q02318 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CYP27A1Q02318 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CYP27A1Q02318 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CYP27A1Q02318 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CYP27A1Q02318 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms