Protein–RNA interactions for Protein: Q00978

IRF9, Interferon regulatory factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF9Q00978 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IRF9Q00978 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IRF9Q00978 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IRF9Q00978 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IRF9Q00978 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IRF9Q00978 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IRF9Q00978 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IRF9Q00978 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IRF9Q00978 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IRF9Q00978 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IRF9Q00978 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IRF9Q00978 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IRF9Q00978 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IRF9Q00978 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IRF9Q00978 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IRF9Q00978 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IRF9Q00978 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IRF9Q00978 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IRF9Q00978 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IRF9Q00978 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IRF9Q00978 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IRF9Q00978 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IRF9Q00978 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IRF9Q00978 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IRF9Q00978 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IRF9Q00978 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IRF9Q00978 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IRF9Q00978 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IRF9Q00978 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IRF9Q00978 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IRF9Q00978 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IRF9Q00978 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IRF9Q00978 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IRF9Q00978 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IRF9Q00978 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IRF9Q00978 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IRF9Q00978 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IRF9Q00978 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IRF9Q00978 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
IRF9Q00978 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
IRF9Q00978 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
IRF9Q00978 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
IRF9Q00978 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
IRF9Q00978 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
IRF9Q00978 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
IRF9Q00978 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
IRF9Q00978 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
IRF9Q00978 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
IRF9Q00978 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
IRF9Q00978 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
IRF9Q00978 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
IRF9Q00978 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IRF9Q00978 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
IRF9Q00978 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IRF9Q00978 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
IRF9Q00978 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
IRF9Q00978 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
IRF9Q00978 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
IRF9Q00978 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IRF9Q00978 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IRF9Q00978 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IRF9Q00978 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
IRF9Q00978 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
IRF9Q00978 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IRF9Q00978 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
IRF9Q00978 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IRF9Q00978 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IRF9Q00978 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
IRF9Q00978 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IRF9Q00978 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IRF9Q00978 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
IRF9Q00978 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IRF9Q00978 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IRF9Q00978 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IRF9Q00978 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IRF9Q00978 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
IRF9Q00978 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
IRF9Q00978 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IRF9Q00978 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IRF9Q00978 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
IRF9Q00978 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IRF9Q00978 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
IRF9Q00978 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IRF9Q00978 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IRF9Q00978 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IRF9Q00978 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IRF9Q00978 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IRF9Q00978 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IRF9Q00978 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IRF9Q00978 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
IRF9Q00978 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IRF9Q00978 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IRF9Q00978 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IRF9Q00978 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IRF9Q00978 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IRF9Q00978 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IRF9Q00978 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IRF9Q00978 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IRF9Q00978 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
IRF9Q00978 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms